More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1848 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 211 aa  423  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  99.53 
 
 		 211 aa  422  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  81.04 
 
 		 211 aa  343  1e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  74.88 
 
 		 211 aa  318  6e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  73.93 
 
 		 211 aa  313  8e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  72.04 
 
 		 211 aa  303  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  74.42 
 
 		 215 aa  298  3e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  78.16 
 
 		 211 aa  286  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  73.95 
 
 		 215 aa  284  9e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  62.98 
 
 		 232 aa  251  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  67.62 
 
 		 232 aa  248  4e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  54.81 
 
 		 223 aa  221  4e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 212 aa  215  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  51.94 
 
 		 212 aa  208  4e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  49.24 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  47.21 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  42.72 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 222 aa  164  5.9999999999999996e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  42.35 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 222 aa  154  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  39.23 
 
 		 239 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.16 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  37.24 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 229 aa  107  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 241 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  41.34 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  32.02 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  35.6 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 235 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  32.02 
 
 		 230 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  35.6 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 284 aa  105  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  36.22 
 
 		 263 aa  104  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  35.68 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  34.72 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 228 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 231 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 274 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  34 
 
 		 223 aa  101  9e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  37.44 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 258 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 247 aa  99  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 255 aa  99  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 231 aa  98.6  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 240 aa  98.2  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 238 aa  97.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 254 aa  97.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 249 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 251 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  39.3 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 262 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 262 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4113  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 230 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 226 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  95.1  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 275 aa  95.1  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 225 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>