More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2906 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 226 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  76.02 
 
 		 230 aa  332  3e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  75.57 
 
 		 230 aa  330  1e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  73.3 
 
 		 225 aa  323  1e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  71.62 
 
 		 224 aa  315  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  71.95 
 
 		 223 aa  309  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  66.22 
 
 		 225 aa  293  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 222 aa  192  4e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 218 aa  189  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  45.67 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 254 aa  178  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  47.03 
 
 		 274 aa  176  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  43.58 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  44.28 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  46.34 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  41.55 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 		 227 aa  171  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  171  9e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  47.47 
 
 		 263 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 251 aa  168  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  41.15 
 
 		 231 aa  167  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 229 aa  164  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  41.63 
 
 		 275 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  43.54 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 232 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 284 aa  141  7e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 245 aa  138  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  39.27 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  37.2 
 
 		 221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  39.79 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  39.79 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  37.13 
 
 		 223 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 223 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 222 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 235 aa  121  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 233 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.47 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  34.91 
 
 		 239 aa  108  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  37.37 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  36.53 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.16 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 238 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  35.14 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.52 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 229 aa  101  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 256 aa  101  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  35.14 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  36.79 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.01 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>