More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2445 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2445  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6860  GntR family transcriptional regulator  72.05 
 
 		 242 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  73.93 
 
 		 222 aa  318  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0043  transcriptional regulator, GntR family  75.12 
 
 		 231 aa  316  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0169991 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0022  GntR domain-containing protein  70.72 
 
 		 228 aa  316  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0023  transcriptional regulator, GntR family  70.72 
 
 		 230 aa  316  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  70.05 
 
 		 237 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  73.81 
 
 		 222 aa  311  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  71.96 
 
 		 222 aa  309  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  48.47 
 
 		 226 aa  181  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  46.83 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  46.83 
 
 		 223 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011894  Mnod_7256  transcriptional regulator, GntR family  48.78 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0660662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  46.39 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  47.96 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3801  GntR-like  45.88 
 
 		 237 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  46.83 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  46.23 
 
 		 216 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  44.5 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1292  GntR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 221 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284438 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2908  GntR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  42.27 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  45.36 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  43.46 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1347  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.744622  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5660  transcriptional regulator GntR family  45.3 
 
 		 227 aa  138  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.495941  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2767  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_6647  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00159077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0520  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.656964  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6458  transcriptional regulator, GntR family  43.09 
 
 		 216 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.467399  normal  0.135131 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3667  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 214 aa  124  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.808717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4082  transcriptional regulator, GntR family  35.19 
 
 		 223 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3004  transcriptional regulator  40.72 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.729807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  38.97 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4792  GntR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.815698  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4473  transcriptional regulator, GntR family  43.65 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.729614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  38.68 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  35.47 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  38.81 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.83 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 230 aa  101  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 233 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.5 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 234 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.24 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 230 aa  99  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 247 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 216 aa  98.6  7e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4801  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0205444  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 222 aa  97.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  96.7  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 226 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  34.87 
 
 		 222 aa  96.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  32.49 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 256 aa  95.1  7e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  34.36 
 
 		 256 aa  95.1  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  94.7  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 223 aa  94.7  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>