More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4931 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  456  1e-127  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  69.63 
 
 		 239 aa  275  6e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  48.62 
 
 		 268 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 226 aa  194  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 226 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  50.71 
 
 		 225 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 240 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  42.18 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  40.67 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  40.29 
 
 		 223 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  39.82 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  45 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 222 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  35.12 
 
 		 224 aa  138  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  38.07 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  36.1 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  30.1 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  37.24 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 267 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 206 aa  118  7e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 		 231 aa  117  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 245 aa  115  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 235 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 245 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  36.14 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  36 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 238 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  36.06 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  32.99 
 
 		 258 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  100  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 262 aa  101  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 238 aa  99.8  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 213 aa  99.4  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 213 aa  98.6  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 228 aa  98.6  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4322  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 207 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  33.19 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 236 aa  95.1  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  32.56 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 236 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 253 aa  94.7  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  34.66 
 
 		 257 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.37 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>