More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0335 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 232 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 232 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  40.29 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  38.71 
 
 		 231 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  42.13 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 231 aa  142  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 230 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 230 aa  136  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  39.25 
 
 		 233 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 235 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  128  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 229 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.56 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  35.35 
 
 		 226 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  36.74 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3782  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0416767  normal  0.193335 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28010  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0384037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0383  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000295575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0450  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.256428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 247 aa  105  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  34.74 
 
 		 229 aa  105  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 223 aa  106  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 		 216 aa  105  5e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 226 aa  105  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  33.79 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  35.05 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02398  hypothetical protein  36.95 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  32.2 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.37 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  28.91 
 
 		 232 aa  102  4e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 396 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1544  GntR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.403257  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003387  propionate catabolism operon transcriptional regulator of GntR family  35.15 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1214  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 220 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000309103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.99 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1422  GntR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 221 aa  102  7e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0669169  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  35.42 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  31.5 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 238 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  29.19 
 
 		 224 aa  99.8  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2569  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.107235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1244  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 229 aa  99.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.376161 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  99  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 248 aa  99  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2188  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.927637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>