More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1966 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  99.57 
 
 
234 aa  473  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  93.16 
 
 
234 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  92.31 
 
 
234 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  94.44 
 
 
234 aa  438  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  93.59 
 
 
234 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  83.41 
 
 
231 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  83.41 
 
 
231 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  83.41 
 
 
231 aa  381  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  83.41 
 
 
231 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  83.41 
 
 
231 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  83.41 
 
 
231 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  83.41 
 
 
231 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  83.41 
 
 
231 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  75.55 
 
 
246 aa  352  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  75.78 
 
 
245 aa  345  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  72.49 
 
 
238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  48.39 
 
 
247 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2435  GntR family transcriptional regulator  48.34 
 
 
252 aa  189  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.410895  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 
252 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2257  transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 
252 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.968354 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  46.12 
 
 
250 aa  175  4e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  44.39 
 
 
259 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  43.72 
 
 
259 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
251 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
263 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  44.5 
 
 
251 aa  168  7e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 
251 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  43.46 
 
 
235 aa  165  6.9999999999999995e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  39.66 
 
 
254 aa  161  9e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  41.33 
 
 
228 aa  159  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  40.47 
 
 
249 aa  158  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
255 aa  155  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 
221 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 
248 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
225 aa  154  8e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  39.73 
 
 
225 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3530  transcriptional regulator GntR  40.25 
 
 
239 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 
230 aa  153  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
247 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 
249 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
244 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 
242 aa  148  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  39.11 
 
 
224 aa  148  6e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3833  GntR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
242 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.644681  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 
233 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 
221 aa  145  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
230 aa  143  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  36.15 
 
 
250 aa  144  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3937  transcriptional regulator, GntR family  40.19 
 
 
251 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0563072  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
244 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1873  transcriptional regulator, GntR family  39.07 
 
 
231 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3371  GntR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
244 aa  142  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  40.85 
 
 
255 aa  141  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0899  transcriptional regulator, GntR family  37.96 
 
 
240 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.278794  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
234 aa  139  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1118  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 
225 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.232597  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1038  transcriptional regulator, GntR family  42.78 
 
 
225 aa  138  6e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2161  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
231 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111337  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
268 aa  138  7.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4320  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
247 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196319  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0680  GntR family transcriptional regulator  38.29 
 
 
226 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231512  normal  0.107075 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  40.28 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3443  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 
235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0727  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.475012 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 
246 aa  132  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 
253 aa  132  5e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 
236 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0834  transcriptional regulator, GntR family  32.73 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 
260 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  37.39 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0471  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
221 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.915136  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 
236 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  37.5 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0403  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
238 aa  128  7.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000148823  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
231 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  36.96 
 
 
229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  37.37 
 
 
234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0657  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 
240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.322488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0914  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
249 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 
237 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1096  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
277 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  37.81 
 
 
237 aa  125  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  37.56 
 
 
230 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
249 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0494  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
245 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.708073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0196  hypothetical protein  39.82 
 
 
244 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
228 aa  123  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3189  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 
268 aa  122  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  36.49 
 
 
252 aa  122  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
246 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2253  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
222 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218359  normal  0.132912 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2469  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 
256 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3485  GntR family transcriptional regulator  37.19 
 
 
222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122835  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
235 aa  119  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
236 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
235 aa  119  3e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>