More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1564 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1564  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 235 aa  94.4  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 219 aa  92  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.86 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 229 aa  89  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  32.18 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 226 aa  85.5  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  30.61 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.98 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4343  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  32.37 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  23.64 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1008  putative glycosyltransferase  30.19 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.120442  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.39 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 346 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  29.5 
 
 		 262 aa  72.8  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0058  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 217 aa  71.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3051  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal  0.14634 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 229 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.21 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  43.21 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3711  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2023  transcriptional regulator, GntR family  23.83 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3095  GntR family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000525729  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  28.77 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0584  transcriptional regulator, GntR family  35.96 
 
 		 231 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.525368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  27.51 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2045  GntR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.612828 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.3 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5170  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 269 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  35.79 
 
 		 232 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  30.95 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  25.94 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  37.63 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  26.71 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3577  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000218035  normal  0.39883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>