More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_1661 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
230 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1199  GntR family transcriptional regulator  92.11 
 
 
226 aa  414  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  76.39 
 
 
221 aa  331  7.000000000000001e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  66.06 
 
 
222 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  64.35 
 
 
222 aa  285  4e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  65.42 
 
 
222 aa  278  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  64.95 
 
 
222 aa  277  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2775  GntR family transcriptional regulator  52.55 
 
 
211 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642476  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
209 aa  191  8e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
214 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  36.22 
 
 
226 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 
232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
215 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 
215 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  32.65 
 
 
224 aa  105  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
260 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
247 aa  104  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
230 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
267 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
231 aa  103  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
222 aa  103  2e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  32.88 
 
 
222 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 
257 aa  102  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  31.98 
 
 
222 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
217 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
226 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
223 aa  98.6  8e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0293  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.972725  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  29.9 
 
 
224 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  29.91 
 
 
227 aa  96.7  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 
232 aa  94.4  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
226 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  29.61 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
240 aa  93.6  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  29.02 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  35.61 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
223 aa  92.4  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6599  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
225 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  30.21 
 
 
223 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
223 aa  91.7  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 
219 aa  91.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 
222 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 
242 aa  90.1  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
223 aa  90.1  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
223 aa  89.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  38.37 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  37.58 
 
 
218 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
224 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1569  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 
230 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 
215 aa  88.2  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 
238 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 
245 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  32.02 
 
 
225 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  34.3 
 
 
227 aa  86.3  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
231 aa  85.9  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  40.94 
 
 
215 aa  85.9  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3629  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
246 aa  85.9  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
230 aa  85.9  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
219 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
224 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0129  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
236 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
222 aa  85.5  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  32.04 
 
 
224 aa  85.1  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 
235 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  35.82 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4341  transcriptional regulator, GntR family  35.52 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.341994 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2016  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0125173 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 
226 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
221 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.8 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.74 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
230 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 
232 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
268 aa  81.6  0.000000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>