More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1743 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  440  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 241 aa  147  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 241 aa  145  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 235 aa  142  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  40.1 
 
 		 234 aa  141  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 262 aa  138  6e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  40.78 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  39.3 
 
 		 230 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 245 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 		 245 aa  131  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  42.21 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  39.2 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.75 
 
 		 231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 222 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 245 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.69 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  38.69 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.69 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.69 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.69 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  38.69 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.69 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.69 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 236 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  38.05 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  38.16 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.73 
 
 		 231 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 247 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 219 aa  125  5e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  36.76 
 
 		 266 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  38.61 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.88 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.88 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.88 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.88 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  37.88 
 
 		 225 aa  121  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  37.62 
 
 		 249 aa  119  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  32.85 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  33.18 
 
 		 225 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  30.84 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 251 aa  105  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  101  7e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  29.61 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 223 aa  92  6e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.58 
 
 		 224 aa  91.3  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  32.18 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 213 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 260 aa  85.5  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 223 aa  85.1  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 214 aa  85.1  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 226 aa  81.6  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 257 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2922  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0278565  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1431  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.773512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.37 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  27.41 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  36.81 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1925  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.554329  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0576  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  27.92 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4523  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  28.14 
 
 		 257 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>