More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1944 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  100 
 
 		 234 aa  484  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  36 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.56 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  35.84 
 
 		 266 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1743  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.821551  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1997  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.74 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4680  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 260 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.895143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3152  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 235 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.26318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2933  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.312545  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 222 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3217  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.57 
 
 		 220 aa  122  7e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3108  transcriptional regulator, GntR family  36.55 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00120217  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3096  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.236033  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02520  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1019  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02484  hypothetical protein  34.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2784  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.220351 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2939  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.150864 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3906  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.429563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2974  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  0.0581705 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2944  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2991  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0247222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4309  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.405303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1042  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2799  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2907  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  34.04 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  31.76 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3365  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3933  transcriptional regulator, GntR family  35.35 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.787186  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4641  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.220796  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5719  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 238 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3565  transcriptional regulator, GntR family  36.94 
 
 		 249 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.181866  normal  0.165295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2798  GntR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 253 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.197773  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3083  transcriptional regulator, GntR family  36.13 
 
 		 237 aa  115  7.999999999999999e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5953  transcriptional regulator, GntR family  35.33 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal  0.0380656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0224  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0204  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5670  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7093  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0156  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 236 aa  111  8.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4140  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 219 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00242001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1198  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3790  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000195314  hitchhiker  0.00275233 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3037  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4153  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.614884 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5085  transcriptional regulator GntR family  36.32 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.131257  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3165  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 246 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.728398  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5700  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3903  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5982  GntR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.28377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5583  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42685 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4203  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8640  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.395019  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0876  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.398436  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2973  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 251 aa  99  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2702  putative transcriptional regulator, GntR family  29.72 
 
 		 219 aa  94.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3459  transcriptional regulator, GntR family  30.65 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3918  regulatory protein GntR HTH  29.8 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.306871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0960  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.411969 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00828  hypothetical protein  28.84 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  27.33 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1812  transcriptional regulator, GntR family  24.89 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.515993  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2768  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.319165  normal  0.0289974 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001646  transcriptional regulator LuxZ  31.41 
 
 		 214 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000706033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4402  transcriptional regulator, GntR family  27.59 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.225327  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  25.12 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  26.19 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 243 aa  70.5  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  27.31 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  26.47 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3891  transcriptional regulator, GntR family  25.33 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.354634 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3589  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.144586 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1913  transcriptional regulator, GntR family  25.81 
 
 		 223 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2004  transcriptional regulator, GntR family  26.74 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1876  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  28.72 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  28.18 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  27.19 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4063  GntR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 243 aa  66.2  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.299746  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3761  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  24.34 
 
 		 215 aa  65.5  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  26.48 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72890  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2536  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00251581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  30.5 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  24.19 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  26.13 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2570  transcriptional regulator  26.82 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.565298  hitchhiker  0.000000111966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>