More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3761 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3761  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0887  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 258 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 226 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 216 aa  96.3  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0544  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314121  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1023  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  34.04 
 
 		 238 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0982  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0526617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2372  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.126259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  35.75 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  30.57 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  34.34 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2469  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 233 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 240 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1060  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3224  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5575  transcriptional regulator GntR family  34.07 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.804429  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3874  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.692905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5269  GntR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.590842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4654  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.456786  normal  0.661063 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8046  transcriptional regulator, GntR family  28.24 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.529008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2783  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.02 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.987951  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  32.9 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2242  GntR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.638324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 253 aa  72  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1728  GntR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 231 aa  72  0.000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.414703  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1795  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2908  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  31.53 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00158542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2875  DNA-binding transcriptional regulator CsiR  32.02 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  32.62 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  32.38 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1944  hypothetical protein  29.71 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  32.68 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2490  transcriptional regulator, GntR family  33.68 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 237 aa  71.2  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  33.8 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  26 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0891  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.881973  normal  0.345535 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5947  GntR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0471  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.915136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  28.79 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  28.35 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03369  Transcriptional regulator, GntR family protein  30.43 
 
 		 220 aa  68.9  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4283  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0724479  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 236 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  29.8 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1873  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.561866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  33.53 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 264 aa  67  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3450  transcriptional regulator, GntR family  24.64 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.101357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 242 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  31.55 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 235 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  29.59 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>