More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2350 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  487  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2360  GntR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 247 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.68775 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 254 aa  226  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4266  transcriptional regulator, GntR family  39.71 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0040  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 231 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 232 aa  98.2  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  33.96 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3038  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340421  normal  0.0334024 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 231 aa  95.9  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3029  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 227 aa  91.7  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 233 aa  90.9  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  30.67 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  32.64 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 225 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 235 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 231 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6326  putative transcriptional regulator  31.55 
 
 		 226 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1028  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000104073  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 239 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 230 aa  88.6  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3756  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 243 aa  88.6  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.435924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 239 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  29.35 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5344  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227261  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 219 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 238 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  34.17 
 
 		 239 aa  85.9  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  29.89 
 
 		 234 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 222 aa  85.5  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  29.13 
 
 		 240 aa  85.5  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 262 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3023  GntR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0530  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.710712  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 256 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5954  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0377161 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0735  transcriptional regulator, GntR family  30.43 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000113476  decreased coverage  0.0012324 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3844  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0591762 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7094  transcriptional regulator, GntR family  31.25 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.113037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.15 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3906  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.756884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5221  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.910392 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5932  GntR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.733777  normal  0.0408892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  25.54 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4135  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 226 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8462  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0634777 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7238  transcriptional regulator GntR family  28.35 
 
 		 224 aa  81.6  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178912  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0899  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.742389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0625  transcriptional regulator, GntR family  26.87 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.699085  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3159  GntR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>