More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5262 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4461  GntR family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 230 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4996  transcriptional regulator, GntR family  56.07 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.555583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 245 aa  181  8.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0240  GntR family transcriptional regulator  50.7 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0882  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0235  GntR family transcriptional regulator  39.72 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  37.26 
 
 		 243 aa  122  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3552  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.430063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2120  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1549  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.945663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3643  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.352701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3629  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1637  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.57865  normal  0.0951778 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1126  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.373714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7955  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 233 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  31.63 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1921  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 213 aa  85.5  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 211 aa  85.1  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2213  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0051  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331225 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  29.77 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2314  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 262 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0726  GntR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  31.1 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4432  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.200664  normal  0.344729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 396 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 265 aa  78.6  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  28.39 
 
 		 254 aa  78.2  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  31.78 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  31.16 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3496  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2014  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3649  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0460435 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1964  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.461761  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 260 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1435  transcriptional regulator, GntR family  26.85 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3132  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.258152  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  32.23 
 
 		 229 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1010  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  normal  0.535113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00490  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00895  transcription regulator protein  31.28 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0473063  normal  0.887973 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  30.04 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  25.23 
 
 		 239 aa  75.1  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3335  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.222517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  29.41 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  27.97 
 
 		 254 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2930  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3094  transcriptional regulator, GntR family  33.95 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00936803  normal  0.247599 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  29.75 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3900  hypothetical protein  33.5 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.365064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  27.93 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2862  GntR domain protein  31.31 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4108  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 227 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal  0.672697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 341 aa  72  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  26.32 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2464  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  29.18 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3448  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3093  GntR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.183416  normal  0.744122 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3435  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 211 aa  71.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.478263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  31.49 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1104  transcriptional regulator, GntR family  29.25 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>