More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1402 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1402  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 341 aa  666    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3370  GntR family transcriptional regulator  39.12 
 
 		 323 aa  179  8e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1033  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000187092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1603  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3969  GntR family transcriptional regulator  33.44 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0992  GntR family transcriptional regulator  42.56 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4672  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.626925  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4205  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5871  transcriptional regulator GntR family  34.88 
 
 		 332 aa  138  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3939  regulatory protein, GntR  34.47 
 
 		 359 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0108432 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1750  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.271582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2086  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 358 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0701877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2145  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22960  transcriptional regulator  34.98 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.483405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5262  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 228 aa  72  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2044  transcriptional regulator, GntR family  28.08 
 
 		 221 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000328211  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6499  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348019  normal  0.174024 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2728  transcriptional regulator, GntR family  33.02 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.246809  normal  0.158024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 229 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3082  GntR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 241 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0349212 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3164  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 242 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0161984 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3219  GntR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0764465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3197  GntR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4554  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  30.58 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5097  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2036  transcriptional regulator, GntR family  31.91 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00223971  normal  0.0618137 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0110  transcriptional regulator, GntR family  27.98 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1408  GntR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1958  GntR domain protein  26.92 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 244 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3140  GntR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117475 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.69 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3872  GntR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.600353  normal  0.77317 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3794  transcriptional regulator, GntR family  30.22 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.436096  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.68 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.68 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2531  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.68 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3144  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3432  GntR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0930  transcriptional regulator, GntR family  26.21 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.491637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3471  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  29.44 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1381  transcriptional regulator, GntR family  25.17 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 253 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  28.02 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2680  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.224385  normal  0.117444 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  26.47 
 
 		 228 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 268 aa  62.4  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 235 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3026  GntR domain protein  26.37 
 
 		 233 aa  62  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 236 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1461  transcriptional regulator, GntR family  33.53 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  27.86 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3666  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 		 234 aa  61.2  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05438  transcription regulator protein  25.91 
 
 		 311 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.185679  normal  0.066253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  28.02 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4293  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1000  transcriptional regulator, GntR family  26.92 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.801369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5188  GntR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.948488  normal  0.0144297 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  26.19 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31590  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 244 aa  60.1  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0161  transcriptional regulator, GntR family  25.83 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.642148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3944  GntR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  41.12 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  33.1 
 
 		 266 aa  60.1  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  41.12 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  26.6 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3541  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  27.9 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>