More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3026 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3026  GntR domain protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3259  GntR domain protein  63.36 
 
 		 233 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2628  regulatory protein GntR HTH  57.34 
 
 		 234 aa  272  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404376  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3580  GntR domain protein  42.48 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2215  regulatory protein GntR HTH  44.1 
 
 		 228 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2228  regulatory protein GntR HTH  43.56 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.814458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.03 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  26.64 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  28.63 
 
 		 272 aa  83.6  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  28.26 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  26.64 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  25.82 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  27.35 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  28.43 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  27.66 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  26.89 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  27.73 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  23.5 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  28.14 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 256 aa  75.1  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  28.71 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  28.38 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.07 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  28.92 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  26.61 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  26.61 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  26.61 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0260  GntR domain-containing protein  27.72 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  25.11 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1606  GntR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 233 aa  72  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  24.32 
 
 		 267 aa  72  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  28.26 
 
 		 253 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  27.67 
 
 		 234 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  29.05 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  28.04 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  27.71 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  26.92 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  27.92 
 
 		 242 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  25.33 
 
 		 244 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 233 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  26.98 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  26.64 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  29.59 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  29.2 
 
 		 254 aa  69.7  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  23.48 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  27.31 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  27.32 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  25.43 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  27.54 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  31.37 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.78 
 
 		 239 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  23.92 
 
 		 235 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  24.17 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  27.85 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 232 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  27.07 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  24.89 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  27.31 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  25.12 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  24.03 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3768  regulatory protein GntR HTH  26.5 
 
 		 254 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  27.85 
 
 		 284 aa  67.4  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  28.43 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  25.96 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  26.05 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 241 aa  67  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  23.38 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  25 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  26.81 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  26.13 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  24.22 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  27.47 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  26.32 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  30.25 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  26.63 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0208  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 229 aa  65.9  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00667385  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  29.3 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>