More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2628 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2628  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 234 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404376  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3259  GntR domain protein  56.89 
 
 		 233 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3026  GntR domain protein  57.34 
 
 		 233 aa  272  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3580  GntR domain protein  45 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2215  regulatory protein GntR HTH  50.23 
 
 		 228 aa  201  7e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2228  regulatory protein GntR HTH  50.69 
 
 		 228 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.814458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  29.13 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  26.32 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  29.24 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  27.88 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  26.32 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  27.98 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  26.32 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  28.26 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  26.17 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  27.23 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  26.29 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  28.89 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  25.75 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 256 aa  75.5  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  27.78 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  28.16 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  28.1 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  24.34 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  27.72 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  26.39 
 
 		 379 aa  72  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  25.91 
 
 		 254 aa  72  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 255 aa  72  0.000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  25.65 
 
 		 250 aa  71.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  26.89 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  25.87 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  25.4 
 
 		 229 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  28.33 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  25.37 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  27.01 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  25.76 
 
 		 259 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  26.98 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  28.33 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  28.31 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  26.92 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  26.92 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  28.18 
 
 		 257 aa  69.7  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  25.98 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  26.41 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  24.52 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  25.46 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  25.64 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  26.61 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.09 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.48 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  26.15 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.03 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  26.67 
 
 		 240 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  29.03 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.03 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  29.03 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.03 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  28.77 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.03 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  26.58 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.03 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1728  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 234 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.177351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  25.35 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  26.58 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  27.73 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  29.03 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  25 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  23.89 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  27.01 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  24.88 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  25.5 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  30.26 
 
 		 241 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>