More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4797 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  96.76 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  73.73 
 
 		 249 aa  365  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  73.19 
 
 		 242 aa  361  5.0000000000000005e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  38.07 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0179  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 241 aa  125  8.000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  35.44 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  35.21 
 
 		 269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2470  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.17 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.78 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08380  transcriptional regulator  32.09 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  33.82 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 		 230 aa  101  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3768  regulatory protein GntR HTH  31.86 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 248 aa  95.5  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  32.61 
 
 		 235 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.39 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 230 aa  89  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  34.18 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 243 aa  86.7  4e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  26.07 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  27.75 
 
 		 227 aa  85.9  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 224 aa  85.9  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  30.28 
 
 		 224 aa  85.5  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  31.78 
 
 		 264 aa  84.7  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  31.56 
 
 		 231 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  31.46 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  30.28 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  34.15 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  32.74 
 
 		 246 aa  83.2  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.58 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  27.43 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 235 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  31.28 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.32 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  27.83 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  29.18 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  25.82 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  32.87 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.13 
 
 		 250 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  33.33 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4879  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  30.23 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.53 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  33.67 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  27.45 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.94 
 
 		 253 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  30.26 
 
 		 247 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 235 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  30.15 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  32.69 
 
 		 239 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  32.3 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  33.54 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1885  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.219739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  30.47 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.15 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 265 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.29 
 
 		 229 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  28.96 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.91 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3484  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0607093  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2254  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385472  normal  0.0729055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  34.55 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  27.49 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  28.97 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  29.78 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  29.39 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6769  regulatory protein GntR HTH  30.85 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  28.5 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>