More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_08380 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_08380  transcriptional regulator  100 
 
 		 237 aa  471  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  51.4 
 
 		 269 aa  215  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3768  regulatory protein GntR HTH  49.77 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  50.66 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2470  transcriptional regulator, GntR family  44 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  39.34 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  37.68 
 
 		 241 aa  128  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  36.42 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  32.09 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  32.09 
 
 		 247 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0179  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 240 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  28.38 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.92 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 245 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.27 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  31.62 
 
 		 284 aa  75.9  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  28.38 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  28.05 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  24.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  24.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  24.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  26.01 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  24.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  31.8 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  24.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  24.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.3 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  24.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  24.87 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.65 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  29.82 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  31.92 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  25.89 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 226 aa  72  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  28.37 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  31.94 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.31 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  29.68 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  30.3 
 
 		 261 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  31.31 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  28 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  33.12 
 
 		 250 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 235 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  26.51 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.06 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  28.96 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  23.83 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  26.07 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  23.83 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  23.83 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  28.5 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.51 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 261 aa  69.3  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 229 aa  68.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  26.07 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  29.32 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  29.91 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  27.48 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  28.7 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  28.44 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.72 
 
 		 228 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.42 
 
 		 243 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  25.81 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  29.3 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  30.9 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.68 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  29.09 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 246 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 248 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  24.26 
 
 		 252 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  25.62 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  28.85 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  28.63 
 
 		 242 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  40.79 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 		 273 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  28.31 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 246 aa  66.2  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  25.7 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2616  GntR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.23468  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  24.17 
 
 		 252 aa  65.9  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>