More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0841 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  499  1e-140  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0850  GntR family transcriptional regulator  64.05 
 
 		 268 aa  290  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  31.86 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.24 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  28.99 
 
 		 379 aa  82.4  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  27.78 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  35.81 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.24 
 
 		 240 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.11 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  29.63 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  30.34 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  29.05 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  30.14 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  26.87 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0036  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 255 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  25.55 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  26.87 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  26.87 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  26.87 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  26.87 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 248 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  29.67 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  24.89 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  26.43 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  28.71 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  26.43 
 
 		 260 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  26.43 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  26.43 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  35.95 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  27.31 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.14 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.53 
 
 		 253 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  29.28 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  26.27 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.97 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  28.16 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  28.96 
 
 		 237 aa  72.8  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.23 
 
 		 252 aa  72.8  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  25.58 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  29.22 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.05 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  29.09 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  26.46 
 
 		 235 aa  72  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  29.44 
 
 		 239 aa  72  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  33.99 
 
 		 240 aa  72  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  29.75 
 
 		 251 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3813  GntR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  25.91 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  29.9 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  27.54 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  25.56 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  27.67 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  29.76 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.73 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.51 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  30.88 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 245 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  27.18 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.79 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  25.11 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  25.11 
 
 		 242 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  27.7 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  25.93 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  30.17 
 
 		 226 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31.79 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  25.11 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  25.11 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  25.11 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  32.78 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  28.84 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 233 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  34.75 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  30.19 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>