More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03037 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 263 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  99.62 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  99.62 
 
 		 263 aa  536  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 260 aa  531  1e-150  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  99.62 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  99.62 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  99.62 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  99.62 
 
 		 260 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 260 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 260 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  88.08 
 
 		 260 aa  471  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  88.46 
 
 		 260 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  85.38 
 
 		 260 aa  457  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  88.84 
 
 		 242 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  59.39 
 
 		 234 aa  277  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  46.43 
 
 		 233 aa  201  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  38.5 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  41.38 
 
 		 237 aa  155  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  35.05 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  35.37 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  36.56 
 
 		 235 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  41.76 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.56 
 
 		 258 aa  112  9e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  27.27 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.57 
 
 		 239 aa  93.2  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  33.91 
 
 		 234 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  29.28 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  28.7 
 
 		 252 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  30.43 
 
 		 226 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  32.19 
 
 		 236 aa  85.9  7e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4443  GntR domain-containing protein  31.45 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.552946  hitchhiker  0.00102346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.19 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.51 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.15 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.44 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  27.39 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4963  GntR domain-containing protein  31.45 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0466274  normal  0.472298 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  30.8 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  30.8 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  30.8 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.87 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29.07 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  28.89 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  32.44 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  28.12 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  29.61 
 
 		 249 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.17 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  31.25 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 252 aa  78.2  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3603  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550725  normal  0.904969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  30.7 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  28.63 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3977  GntR family transcriptional regulator  33 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.355862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  30.84 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  26.12 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  28.15 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 252 aa  76.3  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  30.16 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.43 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2998  GntR domain-containing protein  29.05 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000296609 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  26.72 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  29.48 
 
 		 252 aa  75.9  0.0000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 270 aa  75.5  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  26.55 
 
 		 241 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  26.99 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0841  GntR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  30.39 
 
 		 252 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  28.38 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  31.74 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  28.38 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  26.91 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  29.17 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  27.88 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  27.9 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  32.16 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  33.33 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  25.22 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>