More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0365 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
243 aa  478  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  44.24 
 
 
246 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  43.05 
 
 
226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  45.98 
 
 
243 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  41.36 
 
 
231 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  44.7 
 
 
230 aa  139  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  40.45 
 
 
224 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  40.27 
 
 
239 aa  137  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  42.45 
 
 
224 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.05 
 
 
250 aa  125  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  38.5 
 
 
230 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  38.18 
 
 
233 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  36.41 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  35.32 
 
 
226 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  34.83 
 
 
226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  36.2 
 
 
240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  37.22 
 
 
235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 
230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  34.8 
 
 
238 aa  112  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.94 
 
 
245 aa  111  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.8 
 
 
241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  35 
 
 
241 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.32 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.32 
 
 
228 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  33.92 
 
 
234 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.33 
 
 
239 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
255 aa  106  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  35.55 
 
 
240 aa  105  5e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
241 aa  105  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  35.94 
 
 
233 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  36.82 
 
 
231 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  35.21 
 
 
215 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 
218 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  35.22 
 
 
255 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.45 
 
 
255 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 
255 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 
218 aa  103  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  35.21 
 
 
218 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  40.72 
 
 
235 aa  103  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  35.22 
 
 
255 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  35.22 
 
 
255 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
257 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  35.38 
 
 
240 aa  102  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  37.39 
 
 
257 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
218 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 
218 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  35.37 
 
 
242 aa  100  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
231 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
218 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 
337 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.33 
 
 
256 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.33 
 
 
256 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.33 
 
 
256 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
225 aa  99.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  33.47 
 
 
255 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
234 aa  99.4  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  32.41 
 
 
230 aa  99.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  32.87 
 
 
222 aa  99  6e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
256 aa  99  6e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35 
 
 
232 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  34.56 
 
 
239 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  31.65 
 
 
235 aa  98.6  7e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
240 aa  98.6  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  37.67 
 
 
245 aa  98.6  8e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  35.14 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  35.14 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  33.77 
 
 
254 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  35.14 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 
255 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.89 
 
 
227 aa  98.2  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.6 
 
 
253 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
233 aa  97.1  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 
222 aa  97.4  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 
245 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 
252 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.47 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 
249 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 
245 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  33.48 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  38.6 
 
 
229 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  31.9 
 
 
230 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  34.76 
 
 
267 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  28.7 
 
 
233 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
257 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  38.61 
 
 
222 aa  95.9  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  33.33 
 
 
251 aa  95.9  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 
248 aa  95.9  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>