More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3223 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  100 
 
 		 239 aa  463  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3768  regulatory protein GntR HTH  64.44 
 
 		 254 aa  284  7e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.833334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3776  regulatory protein GntR HTH  56.65 
 
 		 269 aa  231  1e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0209412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08380  transcriptional regulator  50.66 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2470  transcriptional regulator, GntR family  46.4 
 
 		 229 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656489  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  37.22 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 242 aa  131  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6102  GntR domain-containing protein  39.81 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  41.26 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0179  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.89 
 
 		 250 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  33.82 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  33.82 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  38.5 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.3 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.76 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.46 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  33.83 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.63 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  43.12 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  32.27 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.44 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 246 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 249 aa  85.5  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.14 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  34.76 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  31.22 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.05 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  34.48 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  34.53 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.79 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.68 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 337 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  33.75 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  30.21 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  35.47 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2628  regulatory protein GntR HTH  26.32 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.404376  normal  0.597064 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  27.52 
 
 		 237 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  25.56 
 
 		 232 aa  81.6  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  32.03 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  26.81 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  29.31 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.62 
 
 		 253 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  33.62 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 279 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31.67 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  39.63 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.32 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  30.6 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.99 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  32.23 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  34.26 
 
 		 216 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 231 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  36.68 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  27.68 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  27.68 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  33.01 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  29.77 
 
 		 379 aa  78.2  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.5 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.36 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  29.56 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 250 aa  76.6  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  26.98 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  29.65 
 
 		 239 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 		 235 aa  77  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.21 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  31.13 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  33.79 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3259  GntR domain protein  24.09 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.847786  normal  0.0347939 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  33.71 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.2 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>