More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1446 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 227 aa  447  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.05 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  36.49 
 
 		 239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  37.44 
 
 		 231 aa  120  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 233 aa  118  6e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.33 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  37.5 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  38.71 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  37.89 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  37.61 
 
 		 230 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 231 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  36.19 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  36.94 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 337 aa  108  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  33.94 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  33.04 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  35.78 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  39.35 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  36.04 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  36.24 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  34.48 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.64 
 
 		 233 aa  105  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.28 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  35.59 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  32.73 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  35.81 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  37.86 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  41.95 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.63 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  33.33 
 
 		 255 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 251 aa  102  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 249 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 253 aa  102  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  35.91 
 
 		 258 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  36.82 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  30.94 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  36.7 
 
 		 225 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  35.84 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.82 
 
 		 258 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  37.73 
 
 		 235 aa  101  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  38.83 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1270  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.36 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  34.5 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  30.32 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  30.32 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  36.36 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  30.32 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.86 
 
 		 253 aa  99.4  4e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  30.32 
 
 		 223 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  35.34 
 
 		 231 aa  99.4  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  30.32 
 
 		 263 aa  99.4  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 239 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  40.43 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.95 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  32.64 
 
 		 255 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  32.64 
 
 		 255 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  32.64 
 
 		 255 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  33.18 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  33.18 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  30.14 
 
 		 229 aa  98.2  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.44 
 
 		 241 aa  98.2  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  36.65 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.91 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.65 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  34.55 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  34.09 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  31.19 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.39 
 
 		 258 aa  96.3  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  32.21 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  34.29 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30.09 
 
 		 264 aa  95.9  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>