More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_00680 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 
230 aa  455  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  75.34 
 
 
230 aa  326  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  56.42 
 
 
226 aa  241  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  52.29 
 
 
224 aa  228  7e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  53.21 
 
 
231 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  54.09 
 
 
224 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  49.07 
 
 
239 aa  208  5e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  49.55 
 
 
230 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  43.38 
 
 
231 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  45.87 
 
 
246 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  40.27 
 
 
240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  41.59 
 
 
243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  38.95 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
243 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.93 
 
 
245 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.33 
 
 
239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  34.08 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  34.56 
 
 
241 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  35.14 
 
 
241 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 
227 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
233 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  33.18 
 
 
238 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  37.32 
 
 
247 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  36.84 
 
 
247 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.38 
 
 
250 aa  98.2  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  36.32 
 
 
254 aa  97.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  33.79 
 
 
245 aa  95.9  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  33.49 
 
 
273 aa  94.7  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 
261 aa  94.7  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
252 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 
240 aa  92.4  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  33.13 
 
 
228 aa  92.4  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
249 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  33.33 
 
 
238 aa  90.9  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 
240 aa  90.9  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  33.13 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
232 aa  89.7  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30.56 
 
 
218 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  32.08 
 
 
320 aa  89.7  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  36.36 
 
 
250 aa  88.6  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  32.59 
 
 
250 aa  88.6  7e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  30.56 
 
 
256 aa  88.2  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002549  transcriptional repressor for pyruvate dehydrogenase complex  30.56 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 
255 aa  87.8  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  32.63 
 
 
338 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  35.19 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  32.21 
 
 
234 aa  87  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
261 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  29.76 
 
 
255 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  28.77 
 
 
224 aa  87  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  27.94 
 
 
228 aa  86.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.02 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5729  GntR-like  33.16 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6093  GntR domain-containing protein  33.16 
 
 
285 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297598  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  28.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
242 aa  85.9  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  28.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  28.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  28.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03465  transcriptional regulator PdhR  30.09 
 
 
255 aa  86.3  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  28.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  28.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 
229 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  35.54 
 
 
224 aa  85.9  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  33.91 
 
 
258 aa  85.9  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 
258 aa  85.5  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  27.65 
 
 
227 aa  85.5  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  28.44 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  30.81 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  28.44 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 
215 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  30.53 
 
 
250 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  28.44 
 
 
229 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  29.17 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.42 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  29.44 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6576  GntR domain-containing protein  32.65 
 
 
285 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0880698  normal  0.0348714 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1434  GntR domain protein  31.75 
 
 
241 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.809265  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  31.7 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.93 
 
 
264 aa  83.2  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28700  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.915743  normal  0.0614661 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
218 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  35.37 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  30.36 
 
 
250 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>