More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3603 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3603  GntR domain protein  100 
 
 		 224 aa  456  1e-127  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  30.46 
 
 		 231 aa  95.5  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  30.7 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.9 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  28.43 
 
 		 226 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  28.64 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  26.47 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  28.22 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  27.4 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  31 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 337 aa  82  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  26.98 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  27.75 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.98 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.62 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  25 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  25.12 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  25.12 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  31.4 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  29.03 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  29.94 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  28.89 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2422  GntR family transcriptional regulator  28.38 
 
 		 253 aa  78.2  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  28.22 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  30.15 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  27.44 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  25.69 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  27.44 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  30.15 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  28.22 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.37 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.25 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  27.36 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  29.27 
 
 		 258 aa  76.6  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  30.19 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.44 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 288 aa  75.9  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.64 
 
 		 243 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  25.57 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  26.61 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  27.23 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0951  GntR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 235 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  26.01 
 
 		 284 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 226 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  31.14 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  27.93 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  30.1 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  26.36 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 241 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  27.15 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  25.74 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  27.11 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  27.24 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  27.68 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  27.7 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  29.25 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  25.57 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  28.04 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  29.67 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  25.89 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.67 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3125  GntR domain-containing protein  26.15 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  25.52 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  26.32 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  27.88 
 
 		 257 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  25.71 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 247 aa  72  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.75 
 
 		 241 aa  72  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>