More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4197 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4197  GntR domain protein  100 
 
 
246 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.0807308 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  56 
 
 
243 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  45.87 
 
 
230 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  48.18 
 
 
239 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  45.87 
 
 
231 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  44.2 
 
 
230 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  45 
 
 
224 aa  169  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  46.82 
 
 
230 aa  169  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  44.75 
 
 
226 aa  161  8.000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  44.35 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  44.55 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  40 
 
 
240 aa  123  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  38.57 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  36.65 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.04 
 
 
240 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  40.64 
 
 
241 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  40.48 
 
 
215 aa  115  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.62 
 
 
241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  34.38 
 
 
238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
215 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.4 
 
 
239 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
233 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.61 
 
 
251 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  36.97 
 
 
250 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  37.62 
 
 
235 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.71 
 
 
251 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 
247 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  29.13 
 
 
228 aa  98.6  8e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.48 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
337 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  39.88 
 
 
235 aa  97.1  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  37.44 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  35.68 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.93 
 
 
259 aa  96.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  28.85 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  35.09 
 
 
259 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  42.24 
 
 
226 aa  96.3  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 
225 aa  96.3  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  42.17 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  34.5 
 
 
231 aa  95.1  9e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  29.33 
 
 
228 aa  95.1  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
219 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  34.74 
 
 
216 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 
226 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.89 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.89 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.81 
 
 
233 aa  92.4  5e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  38.03 
 
 
224 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.76 
 
 
257 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  37.21 
 
 
231 aa  92  7e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  34.73 
 
 
237 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  36.68 
 
 
231 aa  92  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  36.7 
 
 
253 aa  92  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  36.24 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  33.63 
 
 
257 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
234 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.29 
 
 
227 aa  90.9  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.46 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 
232 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  32.74 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
253 aa  90.9  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  35.84 
 
 
226 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  37.95 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  36.74 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  34.67 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 
216 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  34.29 
 
 
264 aa  89.7  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.01 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.8 
 
 
226 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
253 aa  89  6e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.19 
 
 
230 aa  89  6e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  30.88 
 
 
226 aa  89  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  32.5 
 
 
238 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.91 
 
 
263 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  32.31 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  34.68 
 
 
248 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 
239 aa  88.2  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.91 
 
 
254 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
270 aa  87.8  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  37.06 
 
 
254 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  37.43 
 
 
226 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  29.87 
 
 
250 aa  87  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  28.07 
 
 
266 aa  87  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.13 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  34.73 
 
 
249 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  32.91 
 
 
248 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  29.87 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 
253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  39.88 
 
 
261 aa  86.3  4e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.6 
 
 
240 aa  86.3  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 
248 aa  85.9  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>