More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0503 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 228 aa  455  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0356  GntR domain-containing protein  32.37 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  30.88 
 
 		 242 aa  101  8e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  29.95 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  29 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.05 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  28.78 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.43 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  27.27 
 
 		 264 aa  91.3  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  28.08 
 
 		 243 aa  89  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  28.7 
 
 		 269 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  26.54 
 
 		 250 aa  87  2e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  26.92 
 
 		 241 aa  85.9  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  27.31 
 
 		 231 aa  85.5  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 225 aa  85.5  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 255 aa  85.5  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  26.51 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  25.75 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  26.87 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  25.84 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  27.83 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  25.38 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  25.47 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 256 aa  81.3  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  28.57 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  25.57 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  27.36 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  26.7 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  27.62 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  26.47 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0272  GntR domain protein  26.24 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.554263 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  25.87 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1626  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60188  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  26.47 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  25.98 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  24.66 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  26.64 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3461  GntR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.488404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.89 
 
 		 228 aa  78.2  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  28.06 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3340  regulatory protein GntR, HTH:GntR-like  24.66 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.89 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  24.14 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  28.04 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3324  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2203  GntR domain protein  24.89 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2462  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  26.11 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1242  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  28.92 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 251 aa  77  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0381  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3424  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 230 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.332431  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  25.42 
 
 		 271 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  25.52 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3459  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  29.71 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  23.77 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2705  GntR domain protein  28.33 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.642006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.17 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5458  GntR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0202698 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  25.48 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  25.73 
 
 		 255 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  26.96 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  29.41 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  23.88 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  26.32 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3146  regulatory protein GntR HTH  25 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000023856  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 242 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 258 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  23.87 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  24.31 
 
 		 239 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  23.11 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  29.49 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1202  GntR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  24.68 
 
 		 239 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  28.9 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 242 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  22.97 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  28.3 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  24.64 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  24.34 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  24.64 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  29.41 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3286  regulatory protein GntR HTH  30.63 
 
 		 205 aa  72  0.000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  30.41 
 
 		 231 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>