More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0497 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
242 aa  467  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
242 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  99.59 
 
 
242 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  40.52 
 
 
243 aa  146  3e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  41.52 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  37.28 
 
 
254 aa  110  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 
246 aa  108  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  35.06 
 
 
245 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  33.06 
 
 
240 aa  101  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.38 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  33.49 
 
 
247 aa  98.6  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  35.02 
 
 
262 aa  97.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  37.5 
 
 
242 aa  95.5  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  36.53 
 
 
233 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  36.07 
 
 
235 aa  93.2  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
242 aa  93.2  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  36.84 
 
 
282 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  32.42 
 
 
231 aa  92.8  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
238 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.15 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
239 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
233 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  34.6 
 
 
246 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.33 
 
 
230 aa  90.9  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.75 
 
 
239 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 
379 aa  90.5  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.84 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.52 
 
 
239 aa  90.1  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 
236 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.86 
 
 
258 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.4 
 
 
258 aa  88.6  7e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  34.4 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  34.4 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.4 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  34.4 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.4 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.4 
 
 
258 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.4 
 
 
258 aa  88.2  9e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.3 
 
 
268 aa  88.6  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  27.16 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.9 
 
 
239 aa  87.8  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4956  GntR domain protein  33.04 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114514  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  32.89 
 
 
235 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.83 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  35.05 
 
 
245 aa  87.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  38.05 
 
 
249 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.74 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.74 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 
245 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  36.36 
 
 
236 aa  86.3  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.39 
 
 
233 aa  86.3  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  36.24 
 
 
242 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  31.8 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  35.62 
 
 
234 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.31 
 
 
231 aa  85.9  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 
255 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.42 
 
 
237 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.13 
 
 
256 aa  85.1  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  32.73 
 
 
251 aa  85.5  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  33.81 
 
 
241 aa  85.1  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.09 
 
 
228 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  34.76 
 
 
241 aa  84.7  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  35.21 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.37 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.03 
 
 
257 aa  84  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.14 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.79 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 
253 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.15 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  36.03 
 
 
248 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  39.87 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  34.29 
 
 
263 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  34.55 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  34.67 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  28.81 
 
 
240 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  29.44 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  31.8 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  31.3 
 
 
252 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.22 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  28.83 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  29.03 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  31.36 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  29.03 
 
 
223 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  32.7 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  31.44 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>