More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3843 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  100 
 
 
254 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  71.79 
 
 
239 aa  307  9e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  58.62 
 
 
233 aa  216  4e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  52.12 
 
 
242 aa  211  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  52.38 
 
 
282 aa  211  1e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  51.44 
 
 
240 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  51.44 
 
 
240 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  51.44 
 
 
240 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  52.48 
 
 
251 aa  201  8e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  51.95 
 
 
252 aa  196  3e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  47.28 
 
 
248 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  40.09 
 
 
230 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  34.44 
 
 
245 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  37.72 
 
 
249 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
242 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  36.68 
 
 
232 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  32.52 
 
 
243 aa  95.1  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.97 
 
 
257 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  33.91 
 
 
247 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
246 aa  92.4  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  34.43 
 
 
247 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.6 
 
 
268 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 
240 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  33.64 
 
 
236 aa  88.6  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.78 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.96 
 
 
258 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  33.33 
 
 
237 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.74 
 
 
233 aa  86.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
255 aa  85.9  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
268 aa  85.5  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.88 
 
 
230 aa  85.5  8e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.04 
 
 
261 aa  85.5  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 
233 aa  85.5  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 
235 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  37.61 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3048  GntR-family transcriptional regulator  36.07 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.168987  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  29.24 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  29.24 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.24 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.24 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 
253 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  29.24 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.24 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.24 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  35.78 
 
 
233 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.24 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  37.16 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  36.75 
 
 
264 aa  83.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.08 
 
 
258 aa  83.6  0.000000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  34.25 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  36.15 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 
258 aa  82.8  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
255 aa  82.8  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  33.05 
 
 
239 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  32.44 
 
 
238 aa  82.4  0.000000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  34.45 
 
 
262 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  35.04 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  33.74 
 
 
243 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  35.04 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  33.62 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  35.04 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  35.04 
 
 
249 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  35.04 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  30 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.04 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.76 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  31.6 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.04 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  35.53 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.04 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.13 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  32.7 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.13 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  33.8 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.04 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.61 
 
 
258 aa  79  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 
239 aa  79  0.00000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  31.22 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.701913 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  29.49 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.49 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  31.19 
 
 
250 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.49 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  35.51 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.49 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  29.49 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>