More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2107 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  464  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  76.62 
 
 		 282 aa  340  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  77.49 
 
 		 242 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  56.33 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  52.97 
 
 		 239 aa  219  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  51.44 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  55.7 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  50.42 
 
 		 252 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 248 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.92 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  34.4 
 
 		 233 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 238 aa  87  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  37.16 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  32.52 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  33.76 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  34.4 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 261 aa  81.6  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.51 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.88 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  31.54 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  31.54 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  31.54 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.07 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.54 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.54 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.54 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.54 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  36.08 
 
 		 247 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  33.77 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.93 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  32.69 
 
 		 264 aa  79.3  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  35.09 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.22 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.62 
 
 		 258 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  34.63 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.22 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  35.74 
 
 		 264 aa  77  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  30.57 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  31.51 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  35.91 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  33.81 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.06 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.91 
 
 		 255 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 215 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.75 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  32.14 
 
 		 261 aa  73.6  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.56 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  32.5 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4700  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.445509  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  32.86 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3296  transcriptional regulator, GntR family  33.03 
 
 		 250 aa  72  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.98008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  34.07 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  32.38 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  30.49 
 
 		 269 aa  71.2  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1083  GntR domain protein  33.83 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.67 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  34.23 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.34 
 
 		 268 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  33.48 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  32.68 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  27.35 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1392  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0675425  normal  0.0999005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  26.27 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30 
 
 		 227 aa  70.1  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  29.36 
 
 		 263 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  38.95 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  29.36 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  29.36 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  29.36 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  27.73 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>