More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1326 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  100 
 
 		 264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 255 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  37.85 
 
 		 255 aa  102  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0551  regulatory protein GntR HTH  38.69 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  37.77 
 
 		 261 aa  99.4  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  34.3 
 
 		 257 aa  98.2  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.14 
 
 		 239 aa  96.3  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  35.32 
 
 		 243 aa  96.3  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 255 aa  95.5  9e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  37.33 
 
 		 254 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.2 
 
 		 245 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  37.39 
 
 		 282 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  34.75 
 
 		 235 aa  92.4  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  36.82 
 
 		 233 aa  91.7  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 252 aa  91.3  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3894  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.62 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659933 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  30.37 
 
 		 233 aa  89.7  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  35.05 
 
 		 251 aa  90.1  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  35.76 
 
 		 238 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3910  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.62 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  36.1 
 
 		 242 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  35.24 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  38.14 
 
 		 253 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  36.41 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4017  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.19 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4079  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.19 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.37 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3972  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.19 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.773658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.37 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.37 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.84 
 
 		 258 aa  87.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  31.84 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.84 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  31.84 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.37 
 
 		 257 aa  87  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  31.84 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  36.92 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  33.82 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  33.01 
 
 		 242 aa  87  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  33.61 
 
 		 235 aa  86.7  3e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.84 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  40.99 
 
 		 255 aa  86.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  35.09 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  33.05 
 
 		 250 aa  86.7  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  34.62 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.84 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  35.48 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 245 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 255 aa  86.3  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.84 
 
 		 258 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.84 
 
 		 258 aa  86.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 255 aa  85.9  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 230 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1972  putative pyruvate dehydrogenase complex repressor  37.91 
 
 		 260 aa  85.9  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0510687  normal  0.668194 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  38.05 
 
 		 251 aa  85.9  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  34.26 
 
 		 248 aa  85.9  6e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.21 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.21 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.21 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.21 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  32.21 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  30.29 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.31 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  32.43 
 
 		 258 aa  85.5  9e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  35.81 
 
 		 254 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  31.88 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  31.88 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  31.84 
 
 		 268 aa  84.3  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.88 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  36 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.95 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 272 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  31.88 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  32.17 
 
 		 250 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  34.72 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.78 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  35.62 
 
 		 237 aa  83.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  33.33 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.64 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  32.35 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1141  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 233 aa  82.8  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  37.07 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  33.48 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2324  regulatory protein  35.5 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  33.48 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  33.48 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  32.08 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>