More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1083 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1083  GntR domain protein  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  44.89 
 
 		 247 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  32.68 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3296  transcriptional regulator, GntR family  29.67 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.98008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1072  hypothetical protein  78.26 
 
 		 56 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  35.71 
 
 		 254 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  27.19 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  31.22 
 
 		 282 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  32.87 
 
 		 249 aa  70.1  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  34.8 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2203  GntR domain protein  35.14 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0471303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1846  regulatory protein GntR, HTH  50.59 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4649  GntR domain protein  30.29 
 
 		 218 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  33.73 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 242 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0551  regulatory protein GntR HTH  29.49 
 
 		 263 aa  62  0.000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.85 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0943  regulatory protein GntR HTH  25 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  32.52 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  48.53 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  29.38 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  47.69 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  28.95 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  29.21 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  33.33 
 
 		 240 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  25.65 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  26.51 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 267 aa  56.2  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 253 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1699  GntR domain-containing protein  26.73 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330463  hitchhiker  0.0000606357 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  27.32 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  27.44 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  26.32 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  32.77 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  34.87 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  27.4 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4185  GntR domain-containing protein  28.26 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  24.19 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  24.19 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  24.19 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  24.19 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  30.66 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  30.61 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  32.79 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  30.61 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  30.61 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.29 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.79 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.61 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1537  putative GntR domain protein  23.56 
 
 		 239 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.29 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.79 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  26.46 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.61 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  32.79 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.29 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.29 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  32.79 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.25 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  34.48 
 
 		 254 aa  52.8  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  23.89 
 
 		 234 aa  53.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0693  GntR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 218 aa  53.1  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.362471  normal  0.707531 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  34.21 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  24.66 
 
 		 250 aa  52.8  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  31.34 
 
 		 254 aa  52.8  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  25 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  31.68 
 
 		 270 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  25 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  47.27 
 
 		 263 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  25 
 
 		 250 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  33.61 
 
 		 254 aa  52.4  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>