More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1846 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1846  regulatory protein GntR, HTH  100 
 
 		 251 aa  483  1e-136  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  57.32 
 
 		 249 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 248 aa  91.7  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4834  regulatory protein GntR HTH  41.72 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0551  regulatory protein GntR HTH  33.89 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.838284  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  38.15 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2004  regulatory protein GntR HTH  35.02 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00794918  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  37.2 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  37.65 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  36.28 
 
 		 247 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  34.62 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  33.49 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  34.24 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4590  GntR domain-containing protein  35.92 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.845166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  33.04 
 
 		 256 aa  72  0.000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  34.67 
 
 		 282 aa  72  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 232 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  34.22 
 
 		 242 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  35.02 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 255 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  43.86 
 
 		 268 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  31.98 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  27.27 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 337 aa  68.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1083  GntR domain protein  37.25 
 
 		 226 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  31.09 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 261 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  31.53 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  33.55 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 246 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  29.02 
 
 		 266 aa  67  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 255 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.28 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.19 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.9 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  33.72 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  29.86 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  30.14 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5539  regulatory protein GntR HTH  38.41 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  37.18 
 
 		 231 aa  65.1  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.05 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  35.17 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  31.55 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  37.04 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  35.58 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  35.58 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0109  transcriptional regulator, GntR family  38.67 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.140287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  33.33 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  38.82 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.11 
 
 		 263 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  38.82 
 
 		 233 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  34.39 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.48 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  33.33 
 
 		 229 aa  62  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  35.67 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  30.18 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1317  GntR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 271 aa  61.6  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.193011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2114  GntR domain-containing protein  41.49 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.78102 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.44 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  34.72 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 242 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.55 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 268 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  46.38 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.65 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.19 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  31.3 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.26 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3296  transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.98008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.26 
 
 		 256 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  31.37 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.48 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>