More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4834 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4834  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 269 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670361  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  34.89 
 
 		 249 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1846  regulatory protein GntR, HTH  41.72 
 
 		 251 aa  86.7  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  27.05 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.97 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  32.76 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2004  regulatory protein GntR HTH  31.6 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00794918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.4 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 252 aa  64.3  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  31.25 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  30.41 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  31.93 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  31.93 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  28.77 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  29.25 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.73 
 
 		 239 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  32.92 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  30.91 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  30.95 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  32.72 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  29.55 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  29.59 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.39 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  32.04 
 
 		 240 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  26.36 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 246 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4422  GntR domain-containing protein  44.29 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.99346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  28.5 
 
 		 253 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.07 
 
 		 239 aa  57.4  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  25.64 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.57 
 
 		 263 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  25.64 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  28.7 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.56 
 
 		 255 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  25.64 
 
 		 264 aa  56.6  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  26.69 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  26.27 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0035  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.840145  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  28.12 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  26.61 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  39.5 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  28.24 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  35.62 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  28.41 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  31.37 
 
 		 233 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.71 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  25.9 
 
 		 218 aa  54.7  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.75 
 
 		 253 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4175  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.723796 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 303 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.16 
 
 		 256 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  28.22 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  25.96 
 
 		 241 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  27.16 
 
 		 256 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  29.02 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2228  regulatory protein GntR HTH  30.25 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.814458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.49 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3580  GntR domain protein  23.16 
 
 		 240 aa  53.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.486373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  31.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  31.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  31.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 248 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.1 
 
 		 258 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2928  transcriptional regulator  31.45 
 
 		 249 aa  53.1  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0871114  normal  0.303622 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  30.72 
 
 		 226 aa  52.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  31.1 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  41.77 
 
 		 233 aa  52.8  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 252 aa  52.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 229 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  28.77 
 
 		 248 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4780  regulatory protein GntR HTH  30.59 
 
 		 259 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0978  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.86 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4064  GntR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 227 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.916339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  31.69 
 
 		 225 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>