More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1633 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 251 aa  476  1e-133  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  60.96 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  52.48 
 
 		 254 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  55.7 
 
 		 240 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  54.63 
 
 		 282 aa  218  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  52.7 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 239 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.02 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  35.5 
 
 		 268 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  37.61 
 
 		 247 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  34.91 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  36.75 
 
 		 243 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 232 aa  92.4  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  39.82 
 
 		 249 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  36.02 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  34.88 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.28 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  31.02 
 
 		 245 aa  89.4  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.45 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  32.7 
 
 		 235 aa  87.4  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 242 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 242 aa  85.9  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  27.31 
 
 		 238 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.91 
 
 		 227 aa  85.1  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  34.36 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1326  GntR domain protein  38.03 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  29.07 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  29.07 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  29.07 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  29.07 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  29.07 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  34.22 
 
 		 249 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  32.27 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  30.39 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  31.28 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  31.98 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  32.59 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.21 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  34.29 
 
 		 234 aa  79.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 226 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1846  regulatory protein GntR, HTH  37.2 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  32.09 
 
 		 237 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1083  GntR domain protein  35.47 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0254  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.422711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.2 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3340  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  32.84 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29 
 
 		 239 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  31.98 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  29.18 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  32.57 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  34.36 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  31.8 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 238 aa  75.9  0.0000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  26.91 
 
 		 252 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  37.93 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.21 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 232 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  32.88 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  32.13 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.56 
 
 		 241 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.7 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  29.29 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.07 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  33.49 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  32.04 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  34.62 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0881  GntR domain protein  31.8 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>