More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2306 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2306  GntR domain protein  100 
 
 		 247 aa  473  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0386397 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  36.03 
 
 		 271 aa  112  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.39 
 
 		 241 aa  91.7  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  34.43 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.93 
 
 		 239 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  24.78 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.08 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0962  GntR domain-containing protein  30.77 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.213599  normal  0.953694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4111  regulatory protein GntR HTH  27.93 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 241 aa  86.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  36.09 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  31.8 
 
 		 243 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.31 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  31.42 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  31.42 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  31.42 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.93 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.82 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  29.77 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  29.77 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  29.77 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  29.77 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  29.77 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1633  regulatory protein GntR HTH  33.94 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  37.22 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.11 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.43 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.46 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.2 
 
 		 235 aa  80.1  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  31.76 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  28.88 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  34.55 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  29.31 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  26.22 
 
 		 252 aa  79.3  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 251 aa  79.3  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  31.43 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  27.31 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 233 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  33.17 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  33 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  35.87 
 
 		 245 aa  78.6  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  31.43 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  34.64 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  31.22 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  40.49 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.04 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.04 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.74 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.04 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  33.65 
 
 		 225 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  33.55 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  29.55 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  31.46 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 246 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 256 aa  75.9  0.0000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  29.46 
 
 		 244 aa  75.5  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  27.65 
 
 		 241 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 274 aa  75.5  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  37.34 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  31.49 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.04 
 
 		 258 aa  75.1  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  30.87 
 
 		 249 aa  75.1  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  28.26 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  30.94 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  34.29 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 248 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  36.75 
 
 		 249 aa  73.9  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3223  GntR domain protein  36 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000159971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  30.72 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  37.74 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  36.05 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  32.73 
 
 		 379 aa  73.2  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  34.85 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 337 aa  72.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  31.43 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>