More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3068 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  100 
 
 		 235 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  78.21 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  78.63 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  69.57 
 
 		 237 aa  331  5e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  45.85 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  44.98 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1066  transcriptional regulator NanR  45.58 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.624285  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3533  transcriptional regulator NanR  36.68 
 
 		 242 aa  145  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.606366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3638  transcriptional regulator NanR  36.68 
 
 		 260 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.492438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3531  transcriptional regulator NanR  36.68 
 
 		 260 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0974768  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3700  transcriptional regulator NanR  36.68 
 
 		 260 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3603  transcriptional regulator NanR  36.68 
 
 		 260 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.445383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3837  transcriptional regulator NanR  37.44 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0354157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1517  transcriptional regulator NanR  34.98 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.822162  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3662  transcriptional regulator NanR  36.24 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.215207  normal  0.0850662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03086  transcriptional regulator NanR  35.37 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0480  regulatory protein GntR HTH  35.37 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.143431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0480  transcriptional regulator NanR  35.37 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.426599  normal  0.544762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3521  transcriptional regulator NanR  35.37 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0118397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3550  transcriptional regulator NanR  35.37 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0970448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4543  transcriptional regulator NanR  35.37 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.136259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03037  hypothetical protein  35.37 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.359811  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3708  transcriptional regulator NanR  35.37 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.012881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0854  GntR domain protein  37.12 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00310833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3414  transcriptional regulator NanR  35.37 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 255 aa  118  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 249 aa  114  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  32.74 
 
 		 379 aa  114  8.999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  34.44 
 
 		 238 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.7 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  31.78 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  30.34 
 
 		 233 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  33.97 
 
 		 215 aa  102  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.6 
 
 		 245 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.67 
 
 		 239 aa  101  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29.96 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  28.44 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  26.43 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3193  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  33.01 
 
 		 218 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  29.74 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 243 aa  96.7  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 241 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  96.3  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  33.01 
 
 		 218 aa  95.5  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  27.9 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  33.48 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  26.11 
 
 		 226 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  27.88 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  30.67 
 
 		 238 aa  94.4  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.87 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  29.78 
 
 		 269 aa  94.4  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.36 
 
 		 243 aa  94.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  32.54 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  31.09 
 
 		 249 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.67 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 272 aa  93.2  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 230 aa  93.2  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 239 aa  93.2  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  32.41 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 256 aa  92.4  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  29.61 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 236 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  33.04 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.63 
 
 		 255 aa  92.4  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4324  GntR domain-containing protein  28.02 
 
 		 260 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.133049 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 318 aa  92  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4148  GntR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 246 aa  92  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  28.95 
 
 		 258 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  33.69 
 
 		 255 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  28.14 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 366 aa  89.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 248 aa  89.4  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  31.12 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  28.84 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  30.09 
 
 		 249 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  26.72 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4343  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 274 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 255 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  29.44 
 
 		 229 aa  88.6  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 233 aa  88.6  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>