More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5550 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5550  putative GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  484  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3534  GntR family transcriptional regulator  50.45 
 
 		 248 aa  229  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0913049  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2365  GntR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 251 aa  225  4e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0740393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6461  GntR domain protein  41.98 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0712738  hitchhiker  0.00000516822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2247  GntR domain protein  40.99 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3340  regulatory protein GntR, HTH:GntR-like  37.9 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714467 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4982  GntR domain protein  39.11 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5865  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 		 230 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  33.8 
 
 		 239 aa  105  9e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 233 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.84 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 240 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  32 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  28.45 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  35.47 
 
 		 250 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  33.05 
 
 		 235 aa  99.8  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  31.36 
 
 		 252 aa  95.9  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2418  GntR domain-containing protein  37.02 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.211481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  33.05 
 
 		 264 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  31.82 
 
 		 242 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 230 aa  94.4  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  34.65 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  31.67 
 
 		 244 aa  92  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0353  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 249 aa  91.7  9e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  31.67 
 
 		 244 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  30 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0410  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  34.34 
 
 		 227 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  36.02 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  38.2 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  32.38 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4797  GntR domain protein  28.43 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.19028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  28.19 
 
 		 241 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 258 aa  88.6  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4681  GntR domain protein  27.94 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 256 aa  87.8  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5854  GntR domain protein  37.57 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.712492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  33.19 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  30.15 
 
 		 231 aa  86.3  4e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  27.88 
 
 		 218 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  29.41 
 
 		 233 aa  85.9  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  30.8 
 
 		 246 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  31.31 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.54 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2592  GntR domain protein  39.74 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13093  normal  0.0457135 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 247 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 218 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.04 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  32.74 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0307  GntR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 234 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  35.75 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  27.49 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.49 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.68 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  29.75 
 
 		 238 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  31.88 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0666  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 242 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.355679  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  28.04 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  28 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  30.43 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  30.8 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  32 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  32.7 
 
 		 257 aa  82  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 247 aa  82  0.000000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  29.83 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 252 aa  82  0.000000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5598  GntR domain protein  33.19 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  30.36 
 
 		 249 aa  81.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  29.9 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  29.63 
 
 		 264 aa  81.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  33.98 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3406  GntR domain protein  28.16 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3006  GntR domain protein  32.71 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137902  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  30.69 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  29.13 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  36 
 
 		 258 aa  80.9  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4787  GntR domain protein  29.79 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0496334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  28.77 
 
 		 240 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.16 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>