More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6525 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 253 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  71.02 
 
 		 247 aa  346  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  71.02 
 
 		 247 aa  345  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  60.98 
 
 		 253 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  60.83 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  60.83 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  60.83 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  58.89 
 
 		 253 aa  280  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  59.76 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  56.97 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  56.35 
 
 		 249 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  57.81 
 
 		 249 aa  261  8.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  57.59 
 
 		 251 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  57.5 
 
 		 274 aa  256  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  58.4 
 
 		 251 aa  256  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  53.71 
 
 		 251 aa  245  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  54.89 
 
 		 249 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  54.39 
 
 		 249 aa  241  9e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  54.89 
 
 		 254 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  54.89 
 
 		 249 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2589  GntR family transcriptional regulator  56.22 
 
 		 270 aa  239  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.000313005  normal  0.0123827 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  54.55 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  52.36 
 
 		 272 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 247 aa  228  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05190  Transcriptional regulatory protein, GntR family  54.62 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  52.48 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  52.7 
 
 		 268 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 268 aa  209  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4100  GntR domain protein  50.44 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1885  GntR domain-containing protein  48.12 
 
 		 248 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  56.46 
 
 		 262 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  46.55 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  48.72 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 248 aa  202  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  48.47 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  48.29 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  47.83 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1116  GntR domain-containing protein  49.58 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4759  GntR family transcriptional regulator  50.44 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0000856086  hitchhiker  0.00798136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4633  GntR domain-containing protein  50.44 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.320715  hitchhiker  0.000883916 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4768  GntR domain-containing protein  49.56 
 
 		 233 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.907496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3719  GntR family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 237 aa  168  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  38.46 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1691  GntR domain protein  41.38 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.148925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  39.58 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3539  regulatory protein GntR, HTH  43.98 
 
 		 260 aa  148  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  38.52 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1877  GntR domain protein  39.83 
 
 		 236 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380896  normal  0.264595 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6605  GntR domain protein  39.38 
 
 		 246 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1886  GntR domain-containing protein  40.16 
 
 		 242 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  38.24 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  38.06 
 
 		 299 aa  139  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2473  GntR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 245 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0031  GntR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  35.74 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  38.77 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.49 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 251 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  39.04 
 
 		 234 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3757  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.560097  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3731  GntR domain protein  37.33 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3408  GntR domain protein  37.33 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  38.1 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5903  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.210517  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4274  GntR domain protein  35.91 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.556367 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2173  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.727858  normal  0.299603 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  36.61 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.75 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  38.49 
 
 		 284 aa  119  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5113  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  34.2 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  37.83 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  38.43 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5347  transcriptional regulator GntR family  37.62 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  36.77 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8124  GntR domain protein  33.94 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2484  GntR domain-containing protein  33.78 
 
 		 238 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.120596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.76 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  34.3 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32950  transcriptional regulator, GntR family  45.32 
 
 		 143 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.982848  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  34.08 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6767  GntR domain protein  36.92 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0447  GntR-like  36.92 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4447  GntR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.614266  normal  0.249195 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  31.93 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.22 
 
 		 241 aa  108  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  34.03 
 
 		 258 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4884  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3829  GntR domain-containing protein  28.57 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.710957  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3664  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514259  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  32.79 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3501  GntR domain-containing protein  36.94 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.378835 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>