More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0606 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 245 aa  487  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1674  GntR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  37.24 
 
 		 243 aa  125  6e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2122  GntR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 252 aa  103  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4409  GntR domain protein  33.48 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3843  GntR domain protein  34.44 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  30.04 
 
 		 252 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2588  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 248 aa  97.4  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4061  regulatory protein GntR, HTH  34.02 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36274  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  34.27 
 
 		 282 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1761  GntR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.86506  normal  0.0126946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  36.68 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.76 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  32.91 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  31.66 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0508  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0519  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 242 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  33.62 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 255 aa  89.7  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.1 
 
 		 245 aa  89  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0497  GntR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 242 aa  89  6e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.394596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29.49 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  34.42 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4074  GntR domain-containing protein  30.2 
 
 		 261 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.79 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.76 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 253 aa  87.4  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.76 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  31.71 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  30.51 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.76 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.47 
 
 		 230 aa  86.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 233 aa  86.7  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3301  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0570986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1733  regulatory protein GntR HTH  34.85 
 
 		 249 aa  86.3  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  30.51 
 
 		 228 aa  86.3  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 253 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  31.51 
 
 		 235 aa  85.9  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1043  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7478  glc operon transcriptional activator  31.71 
 
 		 247 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  29.31 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2061  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.476457  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2107  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.924044  normal  0.0750468 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2044  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 240 aa  85.1  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.883511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.7 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  26.51 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 268 aa  83.2  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4435  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 235 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  34.17 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  31.09 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.8 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  28.76 
 
 		 249 aa  82.4  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  28.25 
 
 		 258 aa  82  0.000000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4956  GntR domain protein  30.12 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 236 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 366 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  30.71 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.74 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  31.76 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  34.63 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0833  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0464324 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  27.76 
 
 		 258 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  33.92 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  27.88 
 
 		 230 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2080  GntR domain protein  32.1 
 
 		 233 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  32.05 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  29.23 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  32.24 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  32.43 
 
 		 241 aa  79.3  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  26.51 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  29.49 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 268 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>