More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5224 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  100 
 
 		 244 aa  484  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  49.15 
 
 		 261 aa  201  9e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  49.79 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  42.8 
 
 		 260 aa  171  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  39.65 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  40.72 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  36.94 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  40.81 
 
 		 251 aa  141  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  34.31 
 
 		 246 aa  138  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.12 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  32.83 
 
 		 239 aa  95.9  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  31.44 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  31.39 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.26 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 261 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 248 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  32.44 
 
 		 257 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2079  regulatory protein GntR HTH  30.73 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.744782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.33 
 
 		 230 aa  88.6  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 241 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  33.64 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.22 
 
 		 239 aa  88.2  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  33.64 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 256 aa  87.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  33.64 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  33.64 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  33.64 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  32.2 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  28.76 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 255 aa  85.1  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.86 
 
 		 263 aa  85.1  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 249 aa  85.1  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  31.19 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  32.04 
 
 		 285 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.03 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  27.54 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  31.28 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4351  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 265 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.550174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  30.38 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  30.74 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 255 aa  82  0.000000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  32.62 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  27.54 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  32.62 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  33.33 
 
 		 255 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  32.19 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  30.71 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.51 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  32.05 
 
 		 245 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  33.04 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 270 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1277  GntR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.460205  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  32.76 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  28.07 
 
 		 270 aa  79.7  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  35.04 
 
 		 243 aa  79.7  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  31.38 
 
 		 238 aa  79  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4400  GntR domain-containing protein  33.82 
 
 		 269 aa  79  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.367956  normal  0.0999899 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6575  GntR domain protein  28.7 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00288971  hitchhiker  0.00502555 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  32.05 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  30.96 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  26.25 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7453  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.37 
 
 		 253 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.944668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5340  GntR domain protein  28.63 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0345729 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2181  GntR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.79016  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  29.46 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6745  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.64 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  28.88 
 
 		 270 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.18 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.18 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4956  GntR domain protein  37.43 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.114514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  27.51 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2567  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 281 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.827705 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>