More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3039 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  100 
 
 		 251 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  54.13 
 
 		 242 aa  219  3e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  52.4 
 
 		 246 aa  209  4e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  53.98 
 
 		 253 aa  198  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  42.44 
 
 		 246 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  45.45 
 
 		 234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 256 aa  167  1e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  40.81 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  45.05 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  39.83 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  40.85 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  37.56 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  35.48 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  35.38 
 
 		 285 aa  87  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  31.86 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  34.4 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.73 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0204  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.71 
 
 		 257 aa  82.4  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.502813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2160  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.29 
 
 		 254 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167061  normal  0.198333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.82 
 
 		 251 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3744  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.65 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02849  DNA-binding transcriptional dual regulator, glycolate-binding  31.07 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0051984  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3440  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.07 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0716  GntR domain protein  31.07 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2019  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.65 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.230363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  27.75 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0720  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.07 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3153  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.07 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02799  hypothetical protein  31.07 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00647704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3258  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.07 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2282  regulatory protein GntR, HTH  34.38 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186933 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  29.74 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  36.36 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  30.58 
 
 		 258 aa  79.3  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  31.42 
 
 		 269 aa  79.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  28.45 
 
 		 240 aa  78.6  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1255  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  28.19 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  31.25 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  34.78 
 
 		 236 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  27.39 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.29 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1229  GntR domain-containing protein  30.74 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.82 
 
 		 259 aa  77.8  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.07 
 
 		 245 aa  77  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2203  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.96 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.861815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.51 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1699  GntR domain-containing protein  31.36 
 
 		 513 aa  77  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.330463  hitchhiker  0.0000606357 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.64 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.63 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  34.38 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  29.26 
 
 		 239 aa  76.3  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  29.61 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.1 
 
 		 238 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03226  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  29.36 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.226211  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  34.16 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2307  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.23 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.672341  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  26.79 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  29.41 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.66 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  29.95 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.36 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3349  regulatory protein GntR, HTH  25.64 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2361  GntR domain protein  36.36 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.82 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  31.02 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1705  regulatory protein GntR HTH  33.04 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0259893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  29.11 
 
 		 239 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  29.33 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  29.33 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  34.08 
 
 		 254 aa  72  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  25.69 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 247 aa  72  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  28.57 
 
 		 263 aa  72  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3282  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  32.2 
 
 		 255 aa  72  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  34.1 
 
 		 229 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.29 
 
 		 228 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>