More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3055 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 285 aa  538  9.999999999999999e-153  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  43.66 
 
 		 237 aa  194  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  32.04 
 
 		 244 aa  93.6  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  29.56 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  31.64 
 
 		 253 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  27.62 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  26.88 
 
 		 245 aa  85.5  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  32.12 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 242 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3396  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3176  regulatory protein GntR, HTH  37.23 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.730979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  28.68 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  28.4 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  40.8 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  24.73 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3347  regulatory protein GntR HTH  31.3 
 
 		 255 aa  76.6  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.140801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1106  GntR domain-containing protein  31.82 
 
 		 251 aa  75.9  0.0000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 233 aa  75.9  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  33.01 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6337  GntR domain-containing protein  29.96 
 
 		 226 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0092025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  27.11 
 
 		 246 aa  74.7  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1215  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0659277  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1193  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1314  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  28.62 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1391  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  28.02 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  25.69 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 245 aa  73.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  26.49 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1195  GntR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.187106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1415  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  36.43 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1455  transcriptional regulator, GntR family  27.63 
 
 		 218 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  29.62 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  34.06 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.23 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5531  putative GntR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5532  putative GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  35.94 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3991  transcriptional regulator, GntR family  27.24 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.401302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  27.24 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2688  GntR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 279 aa  70.5  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.292579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01758  hypothetical protein  24.54 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  26.95 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  30.69 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6082  transcriptional regulator GntR family  40.14 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.06 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  39.5 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  39.69 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  39.5 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  26.98 
 
 		 255 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  24.23 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  36.96 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  36.72 
 
 		 239 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  26.98 
 
 		 255 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3766  GntR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  42.11 
 
 		 255 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  27.34 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2789  GntR family transcriptional regulator  38.76 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  24.04 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  27.84 
 
 		 235 aa  67  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6022  GntR domain-containing protein  38.53 
 
 		 338 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  35.77 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  29.21 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  29.3 
 
 		 249 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2015  GntR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.215087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 246 aa  67  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  28.79 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0426  regulatory protein GntR HTH  40.52 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.88 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 257 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0637  GntR domain-containing protein  28.62 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.108013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  27.82 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3384  regulatory protein GntR, HTH  34.92 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.177964  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  38.98 
 
 		 240 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  24.45 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  27.9 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1154  regulatory protein GntR HTH  34.92 
 
 		 241 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.161045  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4749  GntR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  24.11 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  29.63 
 
 		 239 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3457  GntR domain protein  37.4 
 
 		 320 aa  65.9  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.429076  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  28.2 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  28.26 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>