More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2896 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  100 
 
 		 256 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  58.3 
 
 		 261 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  49.79 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  44.87 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 246 aa  158  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  44.84 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  38.39 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  41.89 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  40.85 
 
 		 251 aa  131  9e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  33.61 
 
 		 246 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.9 
 
 		 239 aa  112  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  33.19 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  33.63 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 233 aa  98.6  9e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.06 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 261 aa  96.7  4e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 238 aa  95.5  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  34.07 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  31.58 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 270 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3055  regulatory protein GntR HTH  31.93 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.97 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  27.04 
 
 		 245 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  92  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  33.63 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  33.63 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  29 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  25.75 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5438  transcriptional regulator GntR family  36.09 
 
 		 251 aa  89.7  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.09 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.09 
 
 		 256 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 258 aa  89  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  32.41 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  32.27 
 
 		 250 aa  88.2  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  32.88 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 248 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  39.43 
 
 		 271 aa  88.2  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  32.02 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  30.6 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  30.21 
 
 		 243 aa  88.2  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  33.2 
 
 		 239 aa  87.4  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  36.4 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 255 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  31.15 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  34.4 
 
 		 262 aa  87.8  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2218  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  32.42 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409255  hitchhiker  0.007316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3695  regulatory protein GntR, HTH  27.64 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  33.48 
 
 		 248 aa  87  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  33.2 
 
 		 255 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  34.74 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  31.25 
 
 		 245 aa  86.3  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  34.89 
 
 		 247 aa  86.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  32.26 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  35.55 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  35.65 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 255 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  32.39 
 
 		 285 aa  85.5  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  31.2 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 255 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  30.17 
 
 		 270 aa  85.1  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  29.36 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 288 aa  85.1  9e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.61 
 
 		 228 aa  85.1  9e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  31.06 
 
 		 255 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2589  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  28.4 
 
 		 228 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  31.72 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 255 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  31.25 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 257 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  28.63 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.91 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  32.5 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 337 aa  83.6  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 256 aa  83.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.33 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  28.81 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  29.71 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6391  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.05 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  30.28 
 
 		 253 aa  83.2  0.000000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  32.52 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  29.69 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  32.64 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3742  GntR domain-containing protein  30.7 
 
 		 269 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  30.7 
 
 		 244 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  25.45 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  34.74 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>