More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3401 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5756  GntR domain protein  61.95 
 
 		 236 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  60.26 
 
 		 234 aa  287  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  52.27 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4243  GntR domain-containing protein  62.94 
 
 		 175 aa  223  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.318263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  51.3 
 
 		 242 aa  217  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  35.09 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  33.04 
 
 		 250 aa  111  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  37.39 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  34.78 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 337 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  37.56 
 
 		 246 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3118  transcriptional regulator GntR  36.16 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  38.65 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3254  transcriptional regulator, GntR family  35.93 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.785  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3283  transcriptional regulator, GntR family  36.95 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  36.44 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 257 aa  102  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0365  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1834  GntR domain-containing protein  37.5 
 
 		 250 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  35.4 
 
 		 260 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.86 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  31.39 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 230 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  32.2 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 233 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  36.15 
 
 		 284 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  33.76 
 
 		 256 aa  99.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  38.05 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  34.91 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 255 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2500  GntR domain protein  34.68 
 
 		 248 aa  98.6  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  34.74 
 
 		 242 aa  98.2  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  38.24 
 
 		 240 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  29.36 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3981  GntR domain-containing protein  38.07 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2675  transcriptional regulator GntR  33.04 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0553  GntR domain protein  36.56 
 
 		 253 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0661  GntR domain-containing protein  37.38 
 
 		 232 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.2652  normal  0.118681 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6346  GntR domain-containing protein  33.48 
 
 		 233 aa  95.9  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385639  normal  0.289379 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3676  GntR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 250 aa  95.9  5e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 239 aa  95.9  5e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  34.73 
 
 		 299 aa  95.5  6e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.82 
 
 		 229 aa  95.5  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  34.25 
 
 		 239 aa  95.5  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  34.11 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  33.33 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  36.67 
 
 		 239 aa  95.1  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 255 aa  95.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 270 aa  94.4  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.49 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  33.78 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  33.78 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  32.59 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 		 249 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  34.58 
 
 		 249 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 247 aa  94  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  33.78 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 248 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30.67 
 
 		 235 aa  93.2  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5082  GntR domain-containing protein  34.98 
 
 		 250 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.992616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  34.95 
 
 		 253 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1995  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00626171  normal  0.663234 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  32.76 
 
 		 243 aa  93.6  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 249 aa  92.8  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  32.27 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1727  GntR domain protein  31.51 
 
 		 273 aa  92.8  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000957079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5470  GntR domain protein  35.85 
 
 		 233 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1023  GntR domain-containing protein  34.6 
 
 		 215 aa  92.8  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 252 aa  92.4  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  34.76 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  32.77 
 
 		 245 aa  91.7  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.96 
 
 		 239 aa  91.7  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4063  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 242 aa  91.7  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 252 aa  91.3  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 288 aa  91.3  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  33.73 
 
 		 251 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  35.16 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 318 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  30.32 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  31.69 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  30.32 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  30.32 
 
 		 249 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  30.04 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>