More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12010 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_12010  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 261 aa  505  9.999999999999999e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2896  GntR domain protein  58.3 
 
 		 256 aa  219  3e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0843059  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5224  GntR domain protein  49.15 
 
 		 244 aa  208  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2132  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4765  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4384  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4471  GntR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 242 aa  159  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.788198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7371  transcriptional regulator NanR  45.22 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05160  transcriptional regulator, GntR family  44.28 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3342  GntR family transcriptional regulator  47 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0375  GntR domain protein  37.61 
 
 		 234 aa  136  4e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.400874  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3039  GntR domain protein  45.05 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0453  regulatory protein GntR HTH  33.33 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0156183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19880  transcriptional regulator  35.9 
 
 		 256 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.3 
 
 		 240 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  32.05 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.89 
 
 		 250 aa  98.6  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.8 
 
 		 239 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4412  GntR domain protein  35.22 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  35.39 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  35.39 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  35.39 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1852  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 255 aa  93.2  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0753  GntR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 256 aa  93.2  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.91 
 
 		 230 aa  92  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  39.89 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.8 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  33.88 
 
 		 245 aa  91.3  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0606  GntR domain-containing protein  34.3 
 
 		 245 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  33.62 
 
 		 259 aa  90.5  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  38.25 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2929  GntR domain-containing protein  36.15 
 
 		 257 aa  90.5  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.532881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 245 aa  89.7  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  42.05 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 288 aa  89.7  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 337 aa  89.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  29.46 
 
 		 245 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1175  GntR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 248 aa  87.8  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621986  normal  0.19706 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  34.21 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  33.74 
 
 		 244 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 225 aa  87.8  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5432  GntR domain protein  32.62 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622945  normal  0.658298 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  30.64 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.22 
 
 		 239 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  33.47 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  28.18 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0202  GntR-like  32.34 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.51 
 
 		 229 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1852  GntR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 252 aa  85.1  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.232609  normal  0.988084 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2734  GntR domain protein  33.89 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.341989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3050  GntR domain-containing protein  31.33 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0593714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1712  putative regulatory protein  31 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3405  GntR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1795  putative regulatory protein  31 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3930  GntR domain-containing protein  36.87 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  32.61 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1653  putative regulatory protein  30.7 
 
 		 263 aa  84.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.989828 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1645  putative regulatory protein  31 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1629  putative regulatory protein  31 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  35.23 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  36.21 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1469  GntR domain protein  32.38 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.934444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  31.05 
 
 		 258 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6133  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.5 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  29.66 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00680  transcriptional regulator, GntR family  37.16 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13020  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00181332  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1157  GntR-like  34.05 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00396004  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  35.65 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.98 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  36.95 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  30.25 
 
 		 256 aa  82  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0503  regulatory protein GntR HTH  29.95 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.290884  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  33.63 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  38.24 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.88 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5755  GntR domain protein  32.03 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.166483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1410  GntR domain protein  31.11 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  29.55 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  31.65 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2081  GntR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70710  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  36.24 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.996223  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1432  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0457  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0554  GntR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  28.51 
 
 		 238 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1447  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.384199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>