More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4262 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4262  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 		 244 aa  486  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5996  regulatory protein GntR HTH  91.39 
 
 		 245 aa  447  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.802632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4009  regulatory protein GntR, HTH  91.39 
 
 		 245 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3767  regulatory protein GntR, HTH  91.8 
 
 		 261 aa  448  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000910713  normal  0.101212 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4241  regulatory protein GntR HTH  91.39 
 
 		 245 aa  447  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000218359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4358  regulatory protein GntR, HTH  91.39 
 
 		 245 aa  448  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1662  GntR family transcriptional regulator  90.57 
 
 		 245 aa  443  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00118308  normal  0.121792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.7 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 243 aa  95.9  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  32.1 
 
 		 239 aa  95.5  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2876  GntR domain protein  30.57 
 
 		 245 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.91 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5316  GntR domain protein  32.27 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4031  GntR domain-containing protein  34.5 
 
 		 243 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3963  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 269 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 231 aa  89  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4817  GntR domain protein  34.56 
 
 		 252 aa  89  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.454673  normal  0.999229 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0020  GntR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 256 aa  88.6  8e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.321852  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  31.98 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  28.87 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  28.87 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  26.43 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  28.87 
 
 		 247 aa  86.7  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4767  GntR domain protein  34.76 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.821835  normal  0.117848 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  31.06 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4323  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.57 
 
 		 258 aa  85.9  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.469986 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3689  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 		 247 aa  85.5  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.349225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  30.64 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  30.64 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0527  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.71 
 
 		 258 aa  85.5  7e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  30.64 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.64 
 
 		 257 aa  85.5  7e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0744  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.95 
 
 		 258 aa  85.1  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  30.05 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2629  GntR domain protein  32.24 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0365  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 230 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.64 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  28.45 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.7 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  29.36 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.64 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  30.64 
 
 		 257 aa  85.1  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3401  GntR domain-containing protein  35.87 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3513  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.89 
 
 		 259 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494425  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1232  GntR-like  27.6 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3548  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.7 
 
 		 258 aa  83.6  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.701913 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6600  GntR domain-containing protein  27.6 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.587938  normal  0.274665 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0750  GntR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.33475  normal  0.139544 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  26.75 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2418  GntR domain protein  31.89 
 
 		 251 aa  83.6  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172286  decreased coverage  0.00114845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3391  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.76 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6442  GntR domain protein  28.16 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.143546 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.28 
 
 		 255 aa  82.4  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3387  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  27.88 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3567  GntR domain-containing protein  32.43 
 
 		 245 aa  82  0.000000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  28.32 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0607  regulatory protein GntR HTH  28.32 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6265  GntR domain protein  28.16 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610791 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.32 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.32 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3267  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.32 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3281  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.32 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.368173  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  28.32 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.32 
 
 		 258 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.44 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.44 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1872  GntR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 318 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.345922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  29.58 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3428  Uxu operon transcriptional regulator  29.58 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000900091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  26.64 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.38 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.44 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  29.58 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.83 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.44 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  29.44 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3323  Uxu operon transcriptional regulator  29.58 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.198283  normal  0.784875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  30.08 
 
 		 271 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0628  GntR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 251 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1597  GntR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00340794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  27.59 
 
 		 268 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0552  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.32 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.406636  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0489  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.32 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000298725  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1106  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  28.32 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000240199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  29.11 
 
 		 243 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3280  GntR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 257 aa  79.3  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5994  GntR-like protein  27.23 
 
 		 231 aa  79.3  0.00000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.47604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0787  GntR domain protein  31.19 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.812552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  30.09 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5249  regulatory protein GntR HTH  29.37 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1362  GntR domain protein  31.44 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.971171  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3332  regulatory protein GntR, HTH  29.37 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5035  regulatory protein GntR, HTH  29.37 
 
 		 255 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87866  normal  0.851882 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  30.09 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>