More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0554 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  470  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  37.84 
 
 		 250 aa  148  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 249 aa  129  6e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  34.36 
 
 		 245 aa  125  7e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  34.23 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  38.86 
 
 		 226 aa  119  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  36.87 
 
 		 241 aa  118  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  38.28 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1464  GntR domain protein  38.97 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.232072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  36.97 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 241 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  37.09 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  38.39 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  34.62 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0539  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2780  GntR domain-containing protein  36.16 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1506  uxu operon transcriptional regulator  36.16 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2703  uxu operon transcriptional regulator  36.16 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  34.39 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  39.72 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  35.35 
 
 		 238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1321  regulatory protein GntR HTH  35.11 
 
 		 240 aa  110  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.57427e-29 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  30.53 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  33.66 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  38.1 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  32.13 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  36.32 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  34.1 
 
 		 235 aa  108  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4197  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.675851  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4763  transcriptional regulator NanR  33.79 
 
 		 235 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436481  normal  0.284781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4648  transcriptional regulator NanR  33.33 
 
 		 234 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462339  normal  0.769273 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4518  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 234 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4519  GntR domain protein  33.97 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  32.38 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  36.06 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2904  GntR domain protein  34.51 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111996  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3324  GntR domain protein  34.35 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0977  GntR domain protein  35.09 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0253  GntR domain-containing protein  38.43 
 
 		 262 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1359  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0317585 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 236 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  36.06 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  32.58 
 
 		 234 aa  106  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0986  GntR domain protein  34.35 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.4902  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  36.57 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4228  transcriptional regulator GntR  35.59 
 
 		 249 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0095  transcriptional regulator NanR  35.48 
 
 		 237 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4550  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 249 aa  105  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  40.22 
 
 		 240 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5490  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.46 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.290272  hitchhiker  0.000168771 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 243 aa  105  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4937  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.46 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  34.43 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5644  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  39.53 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.181455  normal  0.540253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  37.79 
 
 		 227 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0823  GntR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691508  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2818  GntR domain-containing protein  35.37 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.325191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0034  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  38.46 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0739  GntR domain protein  34.63 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0933877  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3725  transcriptional regulator NanR  33.48 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1453  GntR domain protein  35.27 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  31.36 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  30.88 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.91 
 
 		 258 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1631  GntR domain protein  40.76 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  33.18 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0759  GntR domain protein  35.38 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2313  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3965  regulatory protein GntR HTH  37.31 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3603  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.180217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3102  GntR domain-containing protein  35.24 
 
 		 249 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  36.79 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  44.65 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 255 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3974  GntR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  33.19 
 
 		 251 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  33.8 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  34.68 
 
 		 222 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1217  GntR domain-containing protein  30.54 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  32.88 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  34.56 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4761  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.553058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4837  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  37.8 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  33.62 
 
 		 257 aa  99.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1795  GntR domain protein  36.99 
 
 		 272 aa  99.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.02855  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 251 aa  99.4  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2520  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2645  GntR domain protein  38.83 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>