More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5046 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5046  GntR domain protein  100 
 
 		 240 aa  469  1.0000000000000001e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0294  GntR domain-containing protein  40.09 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  36.07 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  34.68 
 
 		 238 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  34.21 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 252 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 232 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2283  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4809  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 263 aa  108  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2500  GntR transcriptional regulators family  33.97 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  36.65 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3306  GntR domain-containing protein  35 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3026  pyruvate dehydrogenase complex repressor  32.59 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.509676  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  34.68 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  103  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  33.33 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  34.23 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0366  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  31.98 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  33.04 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2102  transcription regulator protein  34.42 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  32.73 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  28.44 
 
 		 229 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0266  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.267848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  30.28 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8203  transcriptional regulator, GntR family  34.98 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  34.93 
 
 		 254 aa  99.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2241  GntR domain protein  28.45 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.328409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1666  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 255 aa  98.2  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.115082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  31.42 
 
 		 230 aa  98.2  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  31.12 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  33.18 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4851  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.47 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43340  DNA-binding transcriptional regulator GlcC  31.86 
 
 		 259 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.180109  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04193  DNA-binding transcriptional repressor  35.9 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3673  regulatory protein GntR HTH  35.9 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04155  hypothetical protein  35.9 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0699  GntR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0177  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 270 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  37.31 
 
 		 235 aa  97.4  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4923  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.19 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5830  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.19 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4550  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.19 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4789  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.19 
 
 		 257 aa  97.4  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  32.88 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3740  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  35.9 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.714727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  33.93 
 
 		 254 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 233 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  32.05 
 
 		 268 aa  96.3  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1915  GntR domain-containing protein  34.7 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.249377 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  32.43 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 257 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  31.47 
 
 		 245 aa  96.3  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0156  GntR family regulatory protein  32.3 
 
 		 270 aa  95.9  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.000005482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  26.94 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0391  GntR domain-containing protein  31.58 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.35489  normal  0.643361 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0071  GntR domain-containing protein  33.93 
 
 		 258 aa  95.1  8e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 241 aa  95.1  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  34.5 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  34.5 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  34.5 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  34.5 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  34.5 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02963  DNA-binding transcriptional repressor  32.31 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  34.56 
 
 		 255 aa  94.4  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5136  transcriptional regulator GntR family  35.59 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  32.73 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0602  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.31 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  26.94 
 
 		 228 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02914  hypothetical protein  32.31 
 
 		 258 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4861  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.54 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.25238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4908  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.54 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.305801  normal  0.0431827 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4409  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.31 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3566  DNA-binding transcriptional repressor ExuR  32.31 
 
 		 258 aa  94  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4012  transcriptional regulator PdhR  33.19 
 
 		 254 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.152194  normal  0.323384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4911  DNA-binding transcriptional repressor UxuR  36.54 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.460485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>