More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0839 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0839  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 235 aa  484  1e-136  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0503  GntR domain protein  50.43 
 
 		 234 aa  224  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.232387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0271  GntR family transcriptional regulator  46.52 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1787  GntR family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0160831  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  34.15 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  30.17 
 
 		 241 aa  101  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3110  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371117  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  30.53 
 
 		 222 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  31.07 
 
 		 229 aa  99  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  30.08 
 
 		 245 aa  97.1  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  29.67 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4399  GntR domain protein  29.2 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  30.97 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  29.6 
 
 		 245 aa  94.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4280  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.003808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4171  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000336109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4100  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000122034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4221  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000881899  normal  0.895287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4115  transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000173473  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0659  transcriptional regulator PdhR  32.75 
 
 		 254 aa  93.2  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.01329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.38 
 
 		 240 aa  92.4  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0170  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5017  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 231 aa  91.7  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.488746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.754019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0165  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0164  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.808215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0173  transcriptional regulator PdhR  32.31 
 
 		 254 aa  92  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0149565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03641  predicted transcriptional regulator  29.19 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000792391  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4212  GntR domain protein  29.19 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000974871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4123  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860554  normal  0.0423809 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4239  GntR domain-containing protein  29.19 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000023918  decreased coverage  0.00261992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  32.02 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1994  GntR domain-containing protein  33.8 
 
 		 268 aa  91.3  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  0.0993193 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03586  hypothetical protein  29.19 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000443765  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0037  GntR domain protein  37.14 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3974  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 230 aa  90.9  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000445513  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5191  transcriptional regulator, GntR family  29.19 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000012685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0971  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 248 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0558982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0131  DNA-binding transcriptional repressor LldR  30.1 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1263  GntR domain protein  25.54 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 233 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4271  GntR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000161964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  32.77 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  29.86 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00112  transcriptional regulator of pyruvate dehydrogenase complex  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00731446  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0123  transcriptional regulator PdhR  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.739593 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3489  regulatory protein GntR HTH  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000065438  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4164  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0117  transcriptional regulator PdhR  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000950379  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  30.95 
 
 		 261 aa  90.1  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3546  transcriptional regulator PdhR  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000909517  normal  0.0248062 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00111  hypothetical protein  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0201037  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0115  transcriptional regulator PdhR  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00632319  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 215 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0120  transcriptional regulator PdhR  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1590  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.884635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0106  transcriptional regulator PdhR  31.88 
 
 		 254 aa  90.1  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0767654  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3432  GntR domain protein  29.33 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  30.09 
 
 		 261 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1157  GntR domain protein  26.91 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0633  transcriptional regulator PdhR  28.38 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.498815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4109  GntR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000434106  decreased coverage  0.00494792 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  29.11 
 
 		 239 aa  89.4  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  32.14 
 
 		 246 aa  89  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  30.62 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5664  GntR domain protein  30.13 
 
 		 248 aa  88.6  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.0098751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03670  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 268 aa  88.6  7e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.99262 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3755  transcriptional regulator PdhR  28.38 
 
 		 254 aa  88.6  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4977  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.44 
 
 		 258 aa  88.6  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0673  transcriptional regulator PdhR  28.38 
 
 		 254 aa  88.6  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 299 aa  88.6  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03462  DNA-binding transcriptional repressor  29.44 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0101  GntR domain protein  29.44 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4108  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.44 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03413  hypothetical protein  29.44 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3007  GntR domain-containing protein  27.98 
 
 		 270 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.012307  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5148  GntR domain protein  29.2 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.178203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0104  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.44 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3816  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.44 
 
 		 258 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3941  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.44 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0711  GntR domain-containing protein  28.17 
 
 		 243 aa  87.8  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.121808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4030  DNA-binding transcriptional repressor LldR  29.44 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3569  transcriptional regulator PdhR  27.95 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1353  transcriptional regulator, GntR family  28.85 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3714  GntR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0563  GntR domain protein  26.5 
 
 		 241 aa  87  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 247 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8406  regulatory protein GntR HTH  35.37 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  27.04 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  27.59 
 
 		 258 aa  87  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1636  GntR domain-containing protein  30.91 
 
 		 266 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195276  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 229 aa  87.4  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>